More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4000 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  67.21 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  65.57 
 
 		 123 aa  172  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  68.07 
 
 		 121 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  64.46 
 
 		 121 aa  166  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  60 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  57.38 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  56.14 
 
 		 134 aa  147  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  55.56 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  56.03 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  55.17 
 
 		 126 aa  141  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  44.8 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  41.67 
 
 		 497 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  42.48 
 
 		 122 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.3 
 
 		 1352 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.83 
 
 		 1274 aa  107  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 1287 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 		 1245 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  41.79 
 
 		 1574 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.09 
 
 		 1245 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  40 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 1177 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.26 
 
 		 993 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.23 
 
 		 1271 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  44.8 
 
 		 1135 aa  102  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1629 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 947 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.05 
 
 		 1713 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1629 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  40.17 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  43.59 
 
 		 742 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 		 397 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  38.46 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  38.46 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  43.09 
 
 		 735 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  45 
 
 		 763 aa  100  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1625 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0500  histidine kinase  40.91 
 
 		 940 aa  100  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 1977 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  44.14 
 
 		 1200 aa  100  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 		 1189 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3355  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 685 aa  99.4  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  39.66 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.97 
 
 		 1044 aa  99  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.14 
 
 		 1201 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 770 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0876  response regulator receiver  41.18 
 
 		 526 aa  97.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 		 1131 aa  97.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.95 
 
 		 920 aa  97.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  40.17 
 
 		 732 aa  97.1  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  39.02 
 
 		 651 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.2 
 
 		 1480 aa  97.1  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  40.35 
 
 		 736 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  41.73 
 
 		 544 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 		 1158 aa  96.7  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  36 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 827 aa  96.7  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.67 
 
 		 1442 aa  95.9  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.17 
 
 		 991 aa  95.5  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.2 
 
 		 1287 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5565  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.83 
 
 		 1791 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  39.17 
 
 		 385 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  38.84 
 
 		 651 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00947  Signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 		 237 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000206574  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  43.8 
 
 		 125 aa  94.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0392  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  45.54 
 
 		 1374 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 662 aa  94.7  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  34.92 
 
 		 1626 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  40.18 
 
 		 1053 aa  94.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>