More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7418 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  258  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  99.21 
 
 		 126 aa  256  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  91.06 
 
 		 126 aa  233  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  91.06 
 
 		 126 aa  233  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  90.24 
 
 		 126 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  92.5 
 
 		 123 aa  226  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  81.15 
 
 		 123 aa  214  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  79.51 
 
 		 123 aa  213  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  79.51 
 
 		 123 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  79.51 
 
 		 123 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  77.05 
 
 		 123 aa  210  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  79.51 
 
 		 123 aa  209  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  77.05 
 
 		 123 aa  207  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  80 
 
 		 124 aa  207  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  75.41 
 
 		 134 aa  206  7e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  77.05 
 
 		 123 aa  206  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  79.17 
 
 		 144 aa  206  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  75.41 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  79.34 
 
 		 121 aa  205  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  78.51 
 
 		 121 aa  203  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  77.69 
 
 		 124 aa  204  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  76.86 
 
 		 121 aa  202  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  76.86 
 
 		 121 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  77.5 
 
 		 127 aa  202  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  76.03 
 
 		 121 aa  201  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  77.69 
 
 		 121 aa  199  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  76.86 
 
 		 121 aa  199  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  72.5 
 
 		 126 aa  189  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  68.33 
 
 		 121 aa  175  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  55.46 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2781  response regulator receiver protein  51.24 
 
 		 133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  50 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 		 1274 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  42.5 
 
 		 124 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  44.83 
 
 		 129 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 1271 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 		 1352 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  45.37 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 		 948 aa  101  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 1977 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 397 aa  98.2  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 131 aa  98.2  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 		 1245 aa  97.1  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  37.29 
 
 		 742 aa  97.1  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  34.48 
 
 		 497 aa  96.7  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.99 
 
 		 763 aa  95.5  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  40.87 
 
 		 1297 aa  95.1  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 		 929 aa  94.4  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 902 aa  94.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2709  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000626377  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 1172 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 1160 aa  93.6  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  39.52 
 
 		 1060 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0988  response regulator receiver  40.52 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.634077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 1771 aa  92  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3150  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.14204 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 134 aa  92  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 1070 aa  91.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 234 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0257  histidine kinase  42.73 
 
 		 847 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.952647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 		 1007 aa  91.3  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 1044 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0135  response regulator receiver domain-containing protein  46.85 
 
 		 132 aa  91.3  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 123 aa  90.5  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 964 aa  90.1  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 1168 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.83 
 
 		 942 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.83 
 
 		 921 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 967 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000133293 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.83 
 
 		 930 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1792 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50640  response regulator with metal dependent phosphohydrolase activity (two-component)  40.48 
 
 		 347 aa  89.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121542  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.95 
 
 		 778 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  40.34 
 
 		 1765 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1155 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1816 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>