More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5197 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  100 
 
 
134 aa  278  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  59.13 
 
 
123 aa  152  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  56.14 
 
 
125 aa  147  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  54.78 
 
 
123 aa  141  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  54.24 
 
 
123 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  54.78 
 
 
121 aa  137  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  55.75 
 
 
121 aa  131  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  50 
 
 
131 aa  130  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  50 
 
 
128 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  46.96 
 
 
130 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  48.7 
 
 
130 aa  121  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  50.89 
 
 
125 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  50 
 
 
133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  50 
 
 
124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  50 
 
 
124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  45.13 
 
 
131 aa  116  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  46.49 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  48.21 
 
 
126 aa  114  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  47.01 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  48.31 
 
 
119 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  41.23 
 
 
122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.74 
 
 
1977 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  40.17 
 
 
497 aa  104  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  44.64 
 
 
124 aa  103  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  42.86 
 
 
1053 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
124 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  44.64 
 
 
128 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  41.74 
 
 
125 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 
1791 aa  100  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 
121 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 
121 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  39.17 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  39.17 
 
 
121 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  39.17 
 
 
121 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  42.61 
 
 
645 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 
1352 aa  98.6  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 
1234 aa  98.2  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 
1055 aa  98.2  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 
633 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.79 
 
 
2213 aa  97.8  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
1245 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  44.8 
 
 
1030 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  41.59 
 
 
124 aa  97.1  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  39.32 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 
918 aa  96.3  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
802 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  39.32 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  39.32 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 
1096 aa  95.5  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
993 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
1230 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  41.53 
 
 
651 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
778 aa  94.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
1172 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  38.28 
 
 
1574 aa  94.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
126 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.09 
 
 
1237 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  41.03 
 
 
651 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  38.26 
 
 
795 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.69 
 
 
1267 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
130 aa  94  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  40.98 
 
 
982 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
1468 aa  93.6  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  40 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
391 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 
1765 aa  93.6  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.99 
 
 
929 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  40.46 
 
 
852 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  38.66 
 
 
1200 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  40.52 
 
 
1560 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 
782 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
1274 aa  92.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  38.26 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
631 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  41.53 
 
 
1392 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  38.52 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
123 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 
1245 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 
920 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
1189 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  37.1 
 
 
735 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  40 
 
 
641 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  40.83 
 
 
124 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
1238 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  37.6 
 
 
1023 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 
860 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
1271 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
1284 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1923  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 
569 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.285353  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  39.83 
 
 
853 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
1238 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 
1767 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  38.52 
 
 
1236 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  36.67 
 
 
126 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
1275 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.26 
 
 
858 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 
1158 aa  91.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
1058 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  39.29 
 
 
1763 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>