More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1431 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  100 
 
 
121 aa  248  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  99.17 
 
 
121 aa  246  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  95.04 
 
 
121 aa  240  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  94.21 
 
 
121 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  93.39 
 
 
121 aa  236  9e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  92.56 
 
 
121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  90.91 
 
 
121 aa  231  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  76.86 
 
 
126 aa  202  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  76.86 
 
 
126 aa  202  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  76.86 
 
 
126 aa  200  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  76.86 
 
 
126 aa  200  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  77.69 
 
 
124 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  76.03 
 
 
126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  75.21 
 
 
123 aa  196  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  75.21 
 
 
123 aa  194  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  75.21 
 
 
123 aa  194  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  74.38 
 
 
123 aa  193  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  75 
 
 
124 aa  193  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  73.55 
 
 
123 aa  193  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  73.55 
 
 
134 aa  193  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  75.83 
 
 
144 aa  193  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  71.9 
 
 
123 aa  190  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  72.73 
 
 
123 aa  190  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  71.9 
 
 
123 aa  188  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  72.5 
 
 
123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  71.07 
 
 
123 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  70.83 
 
 
127 aa  183  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  69.42 
 
 
126 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  67.5 
 
 
121 aa  168  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  61.34 
 
 
120 aa  152  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2781  response regulator receiver protein  57.02 
 
 
133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  52.5 
 
 
122 aa  133  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  45.45 
 
 
125 aa  114  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  44.92 
 
 
125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
1274 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  43.1 
 
 
123 aa  108  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 
124 aa  106  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  39.47 
 
 
131 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
1352 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0988  response regulator receiver  42.24 
 
 
124 aa  100  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.634077  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  40.52 
 
 
123 aa  100  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  38.66 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  47.57 
 
 
129 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  39.17 
 
 
134 aa  99  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  42.02 
 
 
1060 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
1070 aa  98.6  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
1271 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
1977 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
128 aa  97.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
124 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  40 
 
 
128 aa  97.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
123 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 
1078 aa  95.5  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  42.98 
 
 
248 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2709  response regulator receiver protein  44.07 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000626377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  41.88 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  34.48 
 
 
497 aa  94  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  40.17 
 
 
732 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0135  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 
132 aa  94  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.29 
 
 
763 aa  93.6  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  39.32 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  40.87 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
1771 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  40.34 
 
 
1765 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
1333 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
397 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 
956 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
1172 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  42.37 
 
 
123 aa  92.8  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  37.93 
 
 
121 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 
121 aa  92  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
1160 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
1767 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
1767 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  37.39 
 
 
1297 aa  91.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
778 aa  91.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
123 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
964 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  39.17 
 
 
1331 aa  92  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
1767 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
1044 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
1245 aa  90.9  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 
869 aa  90.9  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
1234 aa  90.5  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
993 aa  90.1  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  37.72 
 
 
742 aa  90.5  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 
818 aa  90.1  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 
929 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  40 
 
 
666 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 
1284 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.61 
 
 
1233 aa  89  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
1786 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
1792 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>