More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4585 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  99.18 
 
 		 133 aa  246  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  87.29 
 
 		 126 aa  221  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  84.17 
 
 		 125 aa  213  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  64.04 
 
 		 121 aa  159  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  61.02 
 
 		 123 aa  156  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  57.38 
 
 		 123 aa  148  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  57.52 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  53.98 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  50 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  50.88 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  50 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 130 aa  116  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 131 aa  110  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 119 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  46.02 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  43.97 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 139 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 397 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1977 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  39.66 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 392 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1274 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  44.76 
 
 		 126 aa  95.9  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 228 aa  95.5  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  46.61 
 
 		 803 aa  95.5  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 1245 aa  94.7  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  41.88 
 
 		 606 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 124 aa  94  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  39.67 
 
 		 224 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 123 aa  92.8  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.67 
 
 		 224 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  43.12 
 
 		 651 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.67 
 
 		 224 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 225 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 236 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  36.36 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.79 
 
 		 1233 aa  90.9  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  42.2 
 
 		 651 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 391 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  45.19 
 
 		 645 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 		 1177 aa  90.1  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 224 aa  90.1  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 123 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 225 aa  89.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 391 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  41.44 
 
 		 1278 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 1160 aa  89.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4732  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.539442  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2464  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 229 aa  88.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  40 
 
 		 223 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 230 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 227 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 1238 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3355  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 685 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 918 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 224 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 224 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 		 1234 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  43.1 
 
 		 589 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.74 
 
 		 1096 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  36.44 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 1238 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 225 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 1230 aa  88.2  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 236 aa  88.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 1238 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 		 1352 aa  88.2  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 1238 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 225 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  42.2 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 235 aa  87.8  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 235 aa  87.8  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  37.93 
 
 		 235 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  39.29 
 
 		 571 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  37.93 
 
 		 235 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 235 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0161  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  37.19 
 
 		 126 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 126 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  37.93 
 
 		 235 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  37.93 
 
 		 235 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  37.93 
 
 		 235 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0674  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0682036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2249  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1143 aa  87  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.673162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  37.93 
 
 		 235 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>