More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3206 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  100 
 
 
126 aa  256  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  73.39 
 
 
144 aa  192  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  74.17 
 
 
126 aa  190  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  74.17 
 
 
126 aa  190  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  74.79 
 
 
124 aa  189  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  72.5 
 
 
126 aa  188  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  72.5 
 
 
126 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  71.67 
 
 
124 aa  188  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  73.33 
 
 
126 aa  189  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  74.17 
 
 
123 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  73.55 
 
 
123 aa  188  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  68.55 
 
 
127 aa  187  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  70 
 
 
123 aa  186  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  69.17 
 
 
123 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  70 
 
 
123 aa  184  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  70 
 
 
123 aa  184  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  68.33 
 
 
134 aa  184  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  68.33 
 
 
123 aa  184  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  70.25 
 
 
121 aa  183  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  72.5 
 
 
123 aa  183  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  70.25 
 
 
121 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  69.17 
 
 
123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  70.25 
 
 
121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  69.17 
 
 
123 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  69.42 
 
 
121 aa  180  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  69.42 
 
 
121 aa  180  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  68.6 
 
 
121 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  68.6 
 
 
121 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  62.5 
 
 
121 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  58.82 
 
 
120 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2781  response regulator receiver protein  56.9 
 
 
133 aa  140  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  51.72 
 
 
122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
123 aa  111  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  48.31 
 
 
125 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  45.08 
 
 
122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  48.28 
 
 
123 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  47.41 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 
1274 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  41.38 
 
 
124 aa  106  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  47.41 
 
 
121 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 
1352 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  44.07 
 
 
126 aa  104  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  50.46 
 
 
139 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  45.83 
 
 
125 aa  103  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  41.94 
 
 
128 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  45.76 
 
 
119 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
1271 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 
948 aa  98.2  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2709  response regulator receiver protein  42.37 
 
 
129 aa  97.1  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000626377  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  40.98 
 
 
128 aa  96.7  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  43.22 
 
 
125 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.1 
 
 
1233 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  43.12 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
1977 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
1044 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
1245 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
397 aa  94.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  40.98 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  40.98 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  39.32 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  41.9 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
1172 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
125 aa  94  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  38.1 
 
 
606 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
940 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0257  histidine kinase  40.68 
 
 
847 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.952647  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  41.32 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
125 aa  92.8  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
1050 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 
1096 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 
1055 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  39.83 
 
 
123 aa  92  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 
1160 aa  91.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  37.12 
 
 
1322 aa  91.3  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
1131 aa  91.7  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  37.29 
 
 
1060 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
627 aa  90.9  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
131 aa  90.9  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.99 
 
 
929 aa  90.1  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  38.39 
 
 
124 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
1070 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 
902 aa  88.6  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.26 
 
 
930 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
869 aa  88.2  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.26 
 
 
921 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.26 
 
 
942 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  40.83 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  36.61 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.3 
 
 
941 aa  87.8  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
1284 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
920 aa  87.4  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  41.9 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
1316 aa  87.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
1079 aa  87.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
1362 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  40.19 
 
 
571 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>