More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0604 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  100 
 
 
123 aa  253  9e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  60.34 
 
 
123 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  57.38 
 
 
125 aa  155  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  59.13 
 
 
134 aa  152  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  61.54 
 
 
121 aa  150  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  60.53 
 
 
123 aa  149  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  54.24 
 
 
128 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  55.56 
 
 
121 aa  138  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  51.72 
 
 
125 aa  133  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  50.42 
 
 
126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  50.42 
 
 
131 aa  131  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  50 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  50 
 
 
133 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  50 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  45 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  48.25 
 
 
139 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  48.25 
 
 
119 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.9 
 
 
1977 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  42.24 
 
 
131 aa  110  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  45.83 
 
 
130 aa  107  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
1274 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.36 
 
 
2213 aa  104  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
124 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  40.71 
 
 
122 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
130 aa  103  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  40.52 
 
 
121 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  41.38 
 
 
121 aa  102  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 
1788 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  43.4 
 
 
732 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.74 
 
 
1857 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 
121 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 
1245 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  41.88 
 
 
736 aa  101  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  47.37 
 
 
1695 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  39.66 
 
 
121 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.74 
 
 
1839 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  40.52 
 
 
121 aa  100  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  42.86 
 
 
1053 aa  100  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2324  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 
1162 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
121 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 
1245 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  39.66 
 
 
121 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0135  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 
132 aa  98.6  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
128 aa  98.6  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
1287 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  40.35 
 
 
125 aa  97.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  46.85 
 
 
1131 aa  96.7  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  41.07 
 
 
130 aa  96.7  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  44.23 
 
 
1765 aa  95.9  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 
827 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
397 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.67 
 
 
920 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 
633 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 
1767 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 
1611 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1923  response regulator receiver domain-containing protein  45.61 
 
 
569 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.285353  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  41.53 
 
 
1574 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 
2099 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 
1959 aa  94.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.86 
 
 
858 aa  94.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  41.88 
 
 
758 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
1352 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
968 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  43.1 
 
 
589 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
993 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 
2099 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
1767 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
1767 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  41.67 
 
 
651 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 
1141 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.02 
 
 
1237 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 
1340 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 
1765 aa  94  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 
865 aa  94  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
1271 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  36.97 
 
 
497 aa  94  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 
778 aa  94  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  40.83 
 
 
651 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
1361 aa  93.6  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.14 
 
 
869 aa  93.6  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  42.37 
 
 
548 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  43.44 
 
 
823 aa  93.2  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  46.15 
 
 
1331 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.13 
 
 
643 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  42.86 
 
 
1028 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
392 aa  92.8  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1234 aa  92  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 
1127 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 
1398 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 
1786 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 
1784 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  43.4 
 
 
1014 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  41.07 
 
 
1233 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.17 
 
 
1143 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
947 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 
1792 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 
964 aa  92  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 
1782 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>