More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1706 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  100 
 
 
131 aa  268  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  57.14 
 
 
130 aa  152  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  52.03 
 
 
123 aa  148  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  54.17 
 
 
130 aa  143  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  50 
 
 
123 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  49.59 
 
 
121 aa  135  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  50.42 
 
 
121 aa  133  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  53.1 
 
 
124 aa  130  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  46.72 
 
 
126 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  43.44 
 
 
125 aa  120  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  44.92 
 
 
125 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  45.13 
 
 
134 aa  116  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  40.62 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  53.27 
 
 
119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  52.34 
 
 
139 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
124 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  40.16 
 
 
124 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
133 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  42.24 
 
 
123 aa  110  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
128 aa  108  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
131 aa  107  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 
392 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.37 
 
 
454 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
397 aa  101  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  41.74 
 
 
124 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 
122 aa  97.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
127 aa  96.7  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  39.02 
 
 
125 aa  95.9  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  37.01 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  37.01 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  39.17 
 
 
260 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 
260 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 
633 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  45.71 
 
 
596 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  43.4 
 
 
128 aa  95.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  39.17 
 
 
260 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.73 
 
 
858 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  38.58 
 
 
262 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  38.84 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  39.37 
 
 
800 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  36.51 
 
 
130 aa  94  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  35.77 
 
 
247 aa  94  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02001  two-component response regulator  39.17 
 
 
265 aa  93.6  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.824437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
564 aa  94  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1494  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 
265 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 
259 aa  93.6  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 
235 aa  93.6  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
125 aa  93.2  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 
924 aa  93.6  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  38.46 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  38.46 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
947 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  41.32 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
391 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 
257 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  38.33 
 
 
121 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.94 
 
 
228 aa  91.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 
246 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 
246 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  39.17 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
1284 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  38.02 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 
236 aa  91.7  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 
246 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  37.5 
 
 
260 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  35.04 
 
 
460 aa  90.9  6e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  38.33 
 
 
258 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  40.71 
 
 
810 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
128 aa  90.1  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
1352 aa  90.1  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  39.34 
 
 
225 aa  90.1  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  34.96 
 
 
247 aa  90.1  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  33.88 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2464  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.59 
 
 
229 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  42.48 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  37.19 
 
 
121 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  38.33 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
1977 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 
234 aa  89.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
1058 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  36.67 
 
 
268 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
778 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  38.33 
 
 
121 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.94 
 
 
751 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  37.19 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 
263 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1199 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
1358 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 
1090 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 
1090 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  40.17 
 
 
1388 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  36.44 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>