More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1051 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  100 
 
 
125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  56.3 
 
 
123 aa  148  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  47.93 
 
 
121 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  50 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  50 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  47.93 
 
 
121 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  48.33 
 
 
124 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  45.45 
 
 
121 aa  114  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  45.45 
 
 
121 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  50 
 
 
144 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  46.34 
 
 
123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  47.2 
 
 
126 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  47.2 
 
 
126 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  46.28 
 
 
121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  47.97 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  47.11 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  46.28 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  48.36 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  46.72 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  47.54 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  45.53 
 
 
123 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  47.15 
 
 
123 aa  110  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  47.5 
 
 
127 aa  110  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  46.34 
 
 
123 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  45.53 
 
 
134 aa  110  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  46.34 
 
 
123 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  45.53 
 
 
123 aa  110  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0988  response regulator receiver  47.9 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.634077  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  42.98 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  49.17 
 
 
123 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 
1101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 
964 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 
1767 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 
1767 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  39.34 
 
 
125 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 
1768 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  40.34 
 
 
1060 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.62 
 
 
1765 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 
1172 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  42.5 
 
 
121 aa  104  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  45.38 
 
 
121 aa  103  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  36.97 
 
 
497 aa  103  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  45.83 
 
 
126 aa  103  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
125 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  45.53 
 
 
123 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  42.02 
 
 
1765 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  43.75 
 
 
124 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
1358 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1039 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  38.52 
 
 
606 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.48 
 
 
929 aa  100  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 
678 aa  100  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  40.98 
 
 
128 aa  100  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
1784 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
1782 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
1786 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  42.98 
 
 
1200 aa  100  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
1792 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 
782 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
1767 aa  100  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
1352 aa  99.4  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
1070 aa  99.8  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 
946 aa  99.4  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.61 
 
 
922 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
833 aa  98.6  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2324  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 
1162 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  40.65 
 
 
130 aa  98.2  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  39.17 
 
 
122 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0533  histidine kinase  42.02 
 
 
244 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  37.5 
 
 
571 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  39.83 
 
 
1331 aa  98.6  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.52 
 
 
918 aa  97.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
818 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1588 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
907 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  39.2 
 
 
667 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
1245 aa  97.1  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.19 
 
 
1271 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
1078 aa  97.1  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 
778 aa  97.1  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
1771 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  41.03 
 
 
979 aa  96.3  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  39.02 
 
 
131 aa  95.9  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
1468 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  35.83 
 
 
1023 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 
916 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  42.37 
 
 
544 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
993 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  39.83 
 
 
1763 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
1407 aa  94.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  37.7 
 
 
794 aa  94.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  40.65 
 
 
125 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  44.17 
 
 
119 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  40 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  43.8 
 
 
125 aa  94.7  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
1189 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
643 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
633 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.26 
 
 
1362 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 
863 aa  94.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>