More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3877 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  263  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  80.77 
 
 		 130 aa  218  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  52.5 
 
 		 121 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 123 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  53.04 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  50.42 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  52.54 
 
 		 124 aa  126  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  45.97 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  50.88 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  50.88 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  50.88 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 123 aa  107  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 139 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 247 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 257 aa  100  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.69 
 
 		 246 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 249 aa  98.6  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 392 aa  97.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 		 947 aa  97.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 263 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.15 
 
 		 246 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 247 aa  95.9  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.15 
 
 		 246 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 124 aa  94  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.13 
 
 		 589 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 397 aa  92.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 272 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 229 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000855765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 		 962 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  37.82 
 
 		 260 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 260 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  37.82 
 
 		 260 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  37.01 
 
 		 1060 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0522  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 125 aa  90.5  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.17 
 
 		 454 aa  90.9  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1310  DNA-binding response regulator  40.32 
 
 		 226 aa  90.1  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02001  two-component response regulator  38.02 
 
 		 265 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.824437 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  36.89 
 
 		 258 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1494  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 265 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1977 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 128 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 229 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  36.72 
 
 		 247 aa  89.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0161  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 232 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  38.74 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  38.6 
 
 		 228 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  38.58 
 
 		 969 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  40.52 
 
 		 229 aa  88.6  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  38.58 
 
 		 971 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5315  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.813269  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0674  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 120 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0682036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 		 633 aa  88.6  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 259 aa  88.6  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 262 aa  88.2  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0537  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2997  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 228 aa  88.2  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 1002 aa  87.8  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  37.5 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 229 aa  88.2  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  36.75 
 
 		 1384 aa  87.4  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.15 
 
 		 1090 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  36.13 
 
 		 260 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 1271 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.15 
 
 		 1090 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 1788 aa  87  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.74 
 
 		 231 aa  87  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 974 aa  87  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0515999 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  34.71 
 
 		 268 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 		 1285 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.15 
 
 		 1053 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  34.71 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 241 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1478 aa  86.3  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  42.02 
 
 		 371 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 		 1101 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4325  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 229 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 755 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  38.79 
 
 		 1373 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  37.61 
 
 		 462 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.22 
 
 		 659 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 1274 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4576  histidine kinase  39.32 
 
 		 678 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.354871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>