More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0497 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  100 
 
 
124 aa  258  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  47.15 
 
 
130 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  50.89 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  50.89 
 
 
124 aa  116  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
131 aa  104  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  44.64 
 
 
121 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  41.59 
 
 
121 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  36.97 
 
 
497 aa  101  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  37.93 
 
 
121 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  37.93 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  37.93 
 
 
126 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  37.93 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 
121 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  37.07 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  36.21 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  36.21 
 
 
121 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  43.7 
 
 
119 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  36.21 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  41.88 
 
 
130 aa  94  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  36.21 
 
 
121 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  39.82 
 
 
123 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  38.26 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  36.89 
 
 
129 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  35.04 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  35.34 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
127 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
130 aa  92  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  34.48 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2997  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  38.39 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  35.04 
 
 
124 aa  90.5  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
125 aa  90.9  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  36.61 
 
 
125 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  32.76 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  32.76 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  32.76 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  32.76 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  32.76 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  33.62 
 
 
123 aa  87.4  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  32.76 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
970 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  39.32 
 
 
1170 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  39.32 
 
 
1172 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  40.54 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  33.91 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  32.76 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  36.36 
 
 
659 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  33.62 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  31.9 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
397 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
392 aa  84.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
858 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  30.17 
 
 
1888 aa  84  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
1274 aa  84  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
1271 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
1713 aa  83.6  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 
1245 aa  83.6  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  38.39 
 
 
121 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  33.62 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  34.48 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  36.45 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
939 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  38.39 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
664 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
1160 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  37.93 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  32.74 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 
977 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3150  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.14204 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  42.2 
 
 
1257 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  36.61 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  39.29 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
948 aa  82  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
927 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  36.61 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1240 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  37.17 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  36.61 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
526 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  33.04 
 
 
732 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
1303 aa  80.9  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  37.5 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3956  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.314568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  30.65 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
1310 aa  80.5  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  34.55 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
776 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
1361 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  34.55 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  34.55 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
1168 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1223  response regulator receiver protein  35 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  36.94 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2177  response regulator receiver protein  38.26 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  30.58 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>