More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5315 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5315  response regulator receiver protein  100 
 
 		 144 aa  281  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.813269  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  60.33 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.65 
 
 		 247 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  36.22 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  36.69 
 
 		 242 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 226 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 243 aa  91.3  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  40.16 
 
 		 355 aa  90.5  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.38 
 
 		 354 aa  90.5  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 523 aa  90.5  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 243 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.01 
 
 		 326 aa  89.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  35.97 
 
 		 242 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 243 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 233 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 248 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  43.65 
 
 		 233 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.78 
 
 		 231 aa  88.6  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  39.17 
 
 		 248 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.25 
 
 		 243 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  36 
 
 		 352 aa  88.2  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  39.17 
 
 		 248 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 216 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 231 aa  87.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  38.14 
 
 		 123 aa  87.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0304  response regulator  34.96 
 
 		 223 aa  86.7  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  36.09 
 
 		 247 aa  86.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  40 
 
 		 269 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 		 228 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  36.69 
 
 		 244 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 255 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  37.19 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 225 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 280 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 246 aa  86.3  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  40.16 
 
 		 402 aa  86.3  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 280 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 		 227 aa  86.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  38.33 
 
 		 248 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  36.75 
 
 		 254 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.5 
 
 		 348 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  36.75 
 
 		 228 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 234 aa  85.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  38.58 
 
 		 248 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  33.05 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.09 
 
 		 246 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  40.87 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2783  two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 245 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.09 
 
 		 1131 aa  84.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.09 
 
 		 246 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  36.07 
 
 		 1127 aa  84.3  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  37.8 
 
 		 248 aa  84.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 		 249 aa  84.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  36.09 
 
 		 257 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  37.8 
 
 		 248 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  37.01 
 
 		 248 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3585  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 		 246 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0667387  hitchhiker  0.00000255607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0373  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 246 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  38.58 
 
 		 234 aa  84.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.98 
 
 		 244 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 246 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2695  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 186 aa  84  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00269866  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  34.75 
 
 		 231 aa  84.3  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  39.32 
 
 		 246 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_94  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 		 228 aa  84  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.81 
 
 		 263 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 223 aa  84  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 369 aa  83.6  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  36.36 
 
 		 326 aa  83.6  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.58 
 
 		 236 aa  83.6  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  38.14 
 
 		 403 aa  83.6  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 225 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  36.97 
 
 		 457 aa  83.6  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  37.82 
 
 		 455 aa  83.6  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 387 aa  83.6  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  37.8 
 
 		 259 aa  83.6  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0547  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.59 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 941 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1352 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  34.59 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 1003 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.3 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  37.01 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2355  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>