More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1037 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  100 
 
 		 247 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  57.38 
 
 		 365 aa  145  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  50 
 
 		 352 aa  141  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.17 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.93 
 
 		 348 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  53.39 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  50.42 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0648  diguanylate phosphodiesterase  53.33 
 
 		 403 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2657  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 128 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0140925  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  52.94 
 
 		 589 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.88 
 
 		 352 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.58 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0463  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  50.42 
 
 		 403 aa  122  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0065  response regulator receiver domain-containing protein  49.58 
 
 		 196 aa  118  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670969  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  47.06 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 288 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  44.44 
 
 		 403 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.26 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 289 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  41.98 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.58 
 
 		 443 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.8 
 
 		 443 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3979  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.66 
 
 		 220 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.704163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.06 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.1 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.09 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  45.08 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 		 1651 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.9 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  42.75 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  29.72 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  37.69 
 
 		 231 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 1426 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  44.44 
 
 		 1427 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.03 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  40 
 
 		 370 aa  99.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  42.52 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3468  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.42 
 
 		 412 aa  99  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 126 aa  99  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  42.52 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  42.52 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.07 
 
 		 226 aa  99  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  41.18 
 
 		 344 aa  98.6  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  40.98 
 
 		 232 aa  98.6  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 257 aa  98.2  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.61 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.13 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1559 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.65 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.88 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  37.16 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.53 
 
 		 231 aa  97.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.1 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  38.85 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17800  response regulator, transcriptional regulatory protein (two-component), ColR  44.26 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.32 
 
 		 313 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  40 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 1383 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4068  response regulator receiver  36.81 
 
 		 377 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706307  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 124 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 121 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.8 
 
 		 1131 aa  96.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.16 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.13 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  37.16 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.23 
 
 		 217 aa  96.3  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  41.32 
 
 		 1202 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30.69 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  40.88 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.8 
 
 		 1956 aa  95.9  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  40.15 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  95.9  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.92 
 
 		 279 aa  95.9  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  42.02 
 
 		 229 aa  95.9  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 223 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.23 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0828  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.23 
 
 		 324 aa  95.5  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>