More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2476 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17800  response regulator, transcriptional regulatory protein (two-component), ColR  83.63 
 
 		 227 aa  388  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4952  putative two-component response regulator  77.09 
 
 		 227 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0901  winged helix family two component transcriptional regulator  77.53 
 
 		 227 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4498  two component transcriptional regulator  76.65 
 
 		 227 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000234919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4486  two component transcriptional regulator  77.53 
 
 		 227 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0969  two component transcriptional regulator  77.53 
 
 		 227 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56950  putative two-component response regulator  76.65 
 
 		 227 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0940  two component transcriptional regulator  77.53 
 
 		 227 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  76.65 
 
 		 227 aa  364  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  76.65 
 
 		 227 aa  364  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1931  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.11 
 
 		 227 aa  348  4e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1726  two component signal transduction response regulator  61.23 
 
 		 227 aa  301  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000605334  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2026  two component transcriptional regulator  57.92 
 
 		 225 aa  271  6e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117597  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3181  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.47 
 
 		 225 aa  271  8.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3245  DNA-binding response regulator  59.28 
 
 		 224 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.124036  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3091  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  59.28 
 
 		 224 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02303  two-component system regulatory protein  57.08 
 
 		 225 aa  266  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04469  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R (raxR)  56.05 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0652  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.26 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04659  two-component system regulatory protein  54.26 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184239  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2611  two component transcriptional regulator  56.14 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1508  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1452  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2992  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.41 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785285  normal  0.0463811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2062  putative two-component response regulator  51.82 
 
 		 272 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658393  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2984  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248048  normal  0.0117446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24350  putative two-component response regulator  51.82 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1244  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.683231 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1047  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 231 aa  224  7e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0730  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 259 aa  224  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.762765  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1162  putative two component system regulatory protein  48.64 
 
 		 233 aa  223  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2296  response regulator receiver domain-containing protein  50.91 
 
 		 222 aa  218  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2129  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.16 
 
 		 231 aa  218  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1189  response regulator  50 
 
 		 229 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2446  response regulator receiver domain-containing protein  44.2 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0706  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2524  DNA-binding response regulator  46.82 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185339  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3011  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  0.458357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2661  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.36546 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1974  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  47.32 
 
 		 223 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.667108 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05570  hypothetical protein  44.09 
 
 		 242 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2251  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 240 aa  205  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1865  DNA-binding response regulator  46.4 
 
 		 223 aa  205  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0418  two-component system response regulator  41.82 
 
 		 221 aa  205  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.815166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0335  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 222 aa  203  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000018466  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001593  putative two-component response regulator  44.09 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000660606  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0620  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4637  DNA-binding response regulator  42.27 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3440  response regulator receiver domain-containing protein  45.45 
 
 		 246 aa  198  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2643  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3317  two component transcriptional regulator  47.27 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2721  DNA-binding response regulator  43.18 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4623  DNA-binding response regulator  45.13 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2375  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.86 
 
 		 235 aa  194  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277723  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.98 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3798  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3577  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003062  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02792  response regulator  44.2 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4252  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542635  unclonable  0.0000000142406 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4196  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 225 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4328  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 225 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  45.65 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  45.67 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4007  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0836  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.33 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0712  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0234002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  44.78 
 
 		 229 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.02 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3630  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0146  response regulator receiver protein  48.42 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2809  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302841  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.05 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.65 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  43.44 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.44 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.36 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  46.22 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 226 aa  175  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9846  two component response regulator  42.79 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  42.86 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.53 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0691  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>