More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0335 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0335  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  454  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000018466  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05570  hypothetical protein  80.63 
 
 		 242 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001593  putative two-component response regulator  78.83 
 
 		 222 aa  370  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000660606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3011  two component transcriptional regulator  74.77 
 
 		 222 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  0.458357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4637  DNA-binding response regulator  69.55 
 
 		 222 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0418  two-component system response regulator  60.63 
 
 		 221 aa  296  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.815166  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4952  putative two-component response regulator  44.09 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1726  two component signal transduction response regulator  45.5 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000605334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0901  winged helix family two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0940  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4486  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0969  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56950  putative two-component response regulator  43.64 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 227 aa  203  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  42.73 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.73 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4498  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000234919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3181  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 225 aa  198  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02303  two-component system regulatory protein  41.89 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04659  two-component system regulatory protein  43.64 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184239  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17800  response regulator, transcriptional regulatory protein (two-component), ColR  41.82 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0652  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2026  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 225 aa  194  6e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117597  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1452  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 237 aa  194  7e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1508  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 237 aa  194  7e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1931  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1854  DNA-binding response regulator  42.66 
 
 		 223 aa  193  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1974  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.53 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.667108 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2524  DNA-binding response regulator  40.99 
 
 		 240 aa  189  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185339  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2062  putative two-component response regulator  43.89 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658393  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2296  response regulator receiver domain-containing protein  42.53 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2251  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2611  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24350  putative two-component response regulator  42.99 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1047  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 231 aa  184  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2129  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 231 aa  184  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2375  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.92 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277723  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1189  response regulator  40.36 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0730  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.762765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2643  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2661  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.36546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1865  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3091  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.73 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04469  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R (raxR)  39.37 
 
 		 238 aa  175  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3245  DNA-binding response regulator  37.27 
 
 		 224 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.124036  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1244  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.683231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2446  response regulator receiver domain-containing protein  37.27 
 
 		 224 aa  173  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28656 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2721  DNA-binding response regulator  38.64 
 
 		 233 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3630  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1162  putative two component system regulatory protein  36.82 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4623  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2992  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785285  normal  0.0463811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.67 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4252  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542635  unclonable  0.0000000142406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0712  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0234002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3798  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003062  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02792  response regulator  38.57 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2809  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0620  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4007  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3440  response regulator receiver domain-containing protein  36.65 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.77 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4196  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 225 aa  158  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0706  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 233 aa  157  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3317  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3577  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4328  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2984  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248048  normal  0.0117446 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.98 
 
 		 238 aa  148  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 635 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  37.78 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  34.06 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  34.53 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  34.98 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.16 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  34.53 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  34.08 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4228  winged helix family two component transcriptional regulator  36 
 
 		 509 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.290807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>