More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0620 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0620  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 229 aa  454  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2524  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 240 aa  238  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185339  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2721  DNA-binding response regulator  51.57 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3440  response regulator receiver domain-containing protein  48.42 
 
 		 246 aa  208  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02303  two-component system regulatory protein  49.11 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3181  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 225 aa  204  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2026  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117597  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1931  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 227 aa  201  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17800  response regulator, transcriptional regulatory protein (two-component), ColR  45.98 
 
 		 227 aa  197  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4498  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000234919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1047  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003062  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4952  putative two-component response regulator  45.54 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56950  putative two-component response regulator  45.09 
 
 		 227 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2446  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0901  winged helix family two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4486  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  46.36 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.36 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0969  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0940  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02792  response regulator  46.4 
 
 		 225 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1726  two component signal transduction response regulator  43.5 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000605334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24350  putative two-component response regulator  47.96 
 
 		 223 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3317  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0652  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04659  two-component system regulatory protein  46.12 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184239  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2062  putative two-component response regulator  47.11 
 
 		 272 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658393  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4252  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542635  unclonable  0.0000000142406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0712  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0234002 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1162  putative two component system regulatory protein  42.27 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1244  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.683231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2129  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1452  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 237 aa  178  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1508  response regulator receiver protein  45.21 
 
 		 237 aa  178  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1189  response regulator  43.42 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3630  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2992  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785285  normal  0.0463811 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001593  putative two-component response regulator  38.74 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000660606  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0706  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  45.81 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05570  hypothetical protein  38.84 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2251  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3011  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  0.458357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2296  response regulator receiver domain-containing protein  40.37 
 
 		 222 aa  167  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1974  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.15 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.667108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2661  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 226 aa  165  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.36546 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4328  two component transcriptional regulator  43.12 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0335  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000018466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4196  two component transcriptional regulator  42.2 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2611  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4623  DNA-binding response regulator  42.66 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04469  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R (raxR)  43.44 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3798  two component transcriptional regulator  43.12 
 
 		 225 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2643  DNA-binding response regulator  41.05 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2375  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.96 
 
 		 235 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277723  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3091  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.64 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1865  DNA-binding response regulator  37.56 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3245  DNA-binding response regulator  38.64 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.124036  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3577  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0418  two-component system response regulator  34.84 
 
 		 221 aa  158  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.815166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4007  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0730  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.762765  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2809  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302841  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4637  DNA-binding response regulator  35.91 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.95 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 635 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2984  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248048  normal  0.0117446 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  40.43 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.12 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.39 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.25 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 635 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0691  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.93 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.65 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 224 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 266 aa  138  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0146  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 220 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 236 aa  137  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 240 aa  138  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>