More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1865 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1865  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003062  DNA-binding response regulator  48.2 
 
 		 225 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02792  response regulator  48.4 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2661  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 226 aa  228  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.36546 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3630  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3317  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 227 aa  221  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2296  response regulator receiver domain-containing protein  49.09 
 
 		 222 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0146  response regulator receiver protein  50.23 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4252  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542635  unclonable  0.0000000142406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1047  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0712  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0234002 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1162  putative two component system regulatory protein  46.61 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56950  putative two-component response regulator  46.4 
 
 		 227 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4952  putative two-component response regulator  46.4 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17800  response regulator, transcriptional regulatory protein (two-component), ColR  46.4 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435874  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4498  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 227 aa  204  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000234919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0901  winged helix family two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 227 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4486  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 227 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0969  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 227 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0940  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 227 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  46.85 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.85 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1244  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.683231 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0730  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.762765  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1452  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1508  response regulator receiver protein  45 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2992  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 237 aa  197  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785285  normal  0.0463811 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04659  two-component system regulatory protein  43.18 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184239  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0652  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04469  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R (raxR)  42.79 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1189  response regulator  42.34 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1726  two component signal transduction response regulator  45.21 
 
 		 227 aa  194  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000605334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1931  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 227 aa  193  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2446  response regulator receiver domain-containing protein  43.75 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02303  two-component system regulatory protein  43.5 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3181  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2026  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2129  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0418  two-component system response regulator  42.99 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.815166  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  38.86 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05570  hypothetical protein  43.44 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2524  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185339  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2611  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0335  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000018466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2251  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3011  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 222 aa  174  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  0.458357 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001593  putative two-component response regulator  42.99 
 
 		 222 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000660606  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2062  putative two-component response regulator  39.09 
 
 		 272 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24350  putative two-component response regulator  38.18 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4623  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0706  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2721  DNA-binding response regulator  40.89 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4637  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1974  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  37.27 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.667108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3577  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3798  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.64 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4007  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4196  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2643  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4328  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2809  two component transcriptional regulator  36.77 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302841  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3245  DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 224 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.124036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.27 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0620  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.56 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2984  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248048  normal  0.0117446 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3091  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.29 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  36.99 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4527  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  36.99 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  38.91 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  35.75 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 263 aa  156  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  36.99 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 799 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  38.74 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 238 aa  154  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2375  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.5 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277723  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  37.56 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  37.1 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  39.37 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 635 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>