More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04469 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04469  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R (raxR)  100 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2992  two component transcriptional regulator, winged helix family  80.79 
 
 		 237 aa  375  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785285  normal  0.0463811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  56.05 
 
 		 227 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56950  putative two-component response regulator  57.4 
 
 		 227 aa  254  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0901  winged helix family two component transcriptional regulator  56.95 
 
 		 227 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4486  two component transcriptional regulator  56.95 
 
 		 227 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0969  two component transcriptional regulator  56.95 
 
 		 227 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0940  two component transcriptional regulator  56.95 
 
 		 227 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4952  putative two-component response regulator  57.4 
 
 		 227 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4498  two component transcriptional regulator  55.16 
 
 		 227 aa  251  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000234919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  56.05 
 
 		 227 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  56.05 
 
 		 227 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17800  response regulator, transcriptional regulatory protein (two-component), ColR  56.05 
 
 		 227 aa  248  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435874  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1931  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 227 aa  241  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3181  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.6 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02303  two-component system regulatory protein  53.36 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2643  DNA-binding response regulator  52.44 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2375  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.56 
 
 		 235 aa  231  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277723  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1726  two component signal transduction response regulator  52.49 
 
 		 227 aa  231  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000605334  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2026  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117597  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04659  two-component system regulatory protein  49.55 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184239  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0652  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2611  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1508  response regulator receiver protein  48.2 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3245  DNA-binding response regulator  48.65 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.124036  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1452  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3091  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.2 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2129  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 231 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0730  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.13 
 
 		 259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.762765  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1162  putative two component system regulatory protein  44.55 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1189  response regulator  48.42 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2296  response regulator receiver domain-containing protein  48.87 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3317  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24350  putative two-component response regulator  49.32 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1047  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2062  putative two-component response regulator  48.87 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658393  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2524  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185339  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0706  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2984  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248048  normal  0.0117446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1865  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2446  response regulator receiver domain-containing protein  41.26 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28656 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1244  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 228 aa  195  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.683231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4252  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542635  unclonable  0.0000000142406 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003062  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3011  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  0.458357 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02792  response regulator  43.18 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1974  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.89 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.667108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2661  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.36546 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3440  response regulator receiver domain-containing protein  42.99 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281357 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05570  hypothetical protein  42.08 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0712  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0234002 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001593  putative two-component response regulator  42.08 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000660606  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3630  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2721  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2251  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 240 aa  181  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0146  response regulator receiver protein  45.25 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.24 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0335  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000018466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4637  DNA-binding response regulator  38.01 
 
 		 222 aa  174  8e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.66 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0418  two-component system response regulator  36.2 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.815166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2809  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  40.95 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0620  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.64 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.34 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4623  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 225 aa  158  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0836  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.79 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.07 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3798  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.89 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3531  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  39.13 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3577  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1713  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.5 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1307  DNA-binding heavy metal response regulator  41.23 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150056  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  40.97 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.44 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.71 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0197  transcriptional activator protein, response regulator  37.12 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0086442  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.99 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4328  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5873  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2069  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.17 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4196  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3465  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1127  heavy metal response regulator  40.79 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294376  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3227  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303749  normal  0.0627816 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4186  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.24384  normal  0.790942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4076  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3708  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6519  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.26 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4290  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>