More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0584 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  100 
 
 		 216 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0648  diguanylate phosphodiesterase  58.28 
 
 		 403 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0463  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  59.33 
 
 		 403 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  62.12 
 
 		 387 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0065  response regulator receiver domain-containing protein  52.94 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670969  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.79 
 
 		 354 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  51.03 
 
 		 289 aa  148  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.26 
 
 		 348 aa  148  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 288 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.38 
 
 		 365 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  58.4 
 
 		 355 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  52.71 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  57.36 
 
 		 589 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  55.37 
 
 		 352 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.57 
 
 		 350 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.07 
 
 		 352 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  43.55 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.16 
 
 		 443 aa  108  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 394 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 230 aa  108  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  43.8 
 
 		 403 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.35 
 
 		 443 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 1341 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.14 
 
 		 1415 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.2 
 
 		 236 aa  104  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 126 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 1003 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.15 
 
 		 1431 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 1711 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  42.19 
 
 		 236 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  44.72 
 
 		 561 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2657  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 128 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0140925  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.02 
 
 		 1131 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.63 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 		 1559 aa  101  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 310 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3979  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.6 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.704163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  39.33 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.26 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  45.24 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 236 aa  99.4  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1631 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.47 
 
 		 308 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 1370 aa  99  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1169  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.47 
 
 		 308 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 1010 aa  98.6  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 123 aa  98.6  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.76 
 
 		 235 aa  98.6  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 1651 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.36 
 
 		 1152 aa  98.2  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 249 aa  98.2  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.86 
 
 		 1390 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 364 aa  98.2  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.86 
 
 		 1390 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.86 
 
 		 1390 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 1385 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  44.25 
 
 		 414 aa  98.2  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  36.99 
 
 		 225 aa  98.2  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1577  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.61 
 
 		 314 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  38.46 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 245 aa  97.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 242 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 244 aa  97.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.6 
 
 		 246 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.6 
 
 		 246 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  34.34 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 247 aa  96.7  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.9 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.96 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  42.02 
 
 		 170 aa  97.1  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 134 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 132 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  39.17 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 397 aa  96.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 132 aa  96.3  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.42 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.42 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 531 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  37.91 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 248 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  45.16 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  42.24 
 
 		 123 aa  95.9  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17800  response regulator, transcriptional regulatory protein (two-component), ColR  36.26 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435874  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  40.65 
 
 		 919 aa  95.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.2 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  42.62 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.98 
 
 		 345 aa  95.5  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 1646 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>