More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2881 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  77.42 
 
 		 216 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  77.42 
 
 		 216 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  75.93 
 
 		 225 aa  334  5e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  75.93 
 
 		 225 aa  334  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 215 aa  308  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.74 
 
 		 217 aa  298  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 231 aa  181  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.2 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.23 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 235 aa  164  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 242 aa  158  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  38.05 
 
 		 242 aa  158  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 242 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  37.13 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.91 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  37.99 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  36.68 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  37.12 
 
 		 242 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 245 aa  148  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  36.73 
 
 		 233 aa  147  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  35.91 
 
 		 227 aa  141  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11994  diatom response regulator 2  33.18 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  37.38 
 
 		 232 aa  128  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3979  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.704163 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45539  diatom response regulator 1  32.29 
 
 		 319 aa  123  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.15 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  33.81 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.44 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.94 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  44.22 
 
 		 257 aa  118  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 223 aa  117  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  33.48 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  33.48 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  31.55 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.97 
 
 		 246 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.13 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 240 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  36.15 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.72 
 
 		 354 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.68 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0499  two component transcriptional regulator  35.5 
 
 		 223 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  35.82 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  33.5 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  35.82 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.12 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.77 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0496  response regulator  35.82 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4716  DNA-binding response regulator  35 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  29.15 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0498  response regulator  35.82 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0641  DNA-binding response regulator  35.82 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0623  DNA-binding response regulator  35 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0711  DNA-binding response regulator  34.5 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0650  DNA-binding response regulator  34.5 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  32.21 
 
 		 239 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  32.08 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  43.62 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  38.92 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.68 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  34.29 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 242 aa  111  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  37.79 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.7 
 
 		 326 aa  111  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  34.76 
 
 		 231 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.21 
 
 		 239 aa  111  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  32.72 
 
 		 242 aa  111  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.02 
 
 		 247 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.24 
 
 		 237 aa  111  9e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.98 
 
 		 243 aa  111  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 201 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 201 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.31 
 
 		 236 aa  111  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>