More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45539 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45539  diatom response regulator 1  100 
 
 		 319 aa  665    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11994  diatom response regulator 2  45.37 
 
 		 222 aa  197  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.64 
 
 		 226 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 233 aa  156  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  36.75 
 
 		 242 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 231 aa  155  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  36.75 
 
 		 242 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.9 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.96 
 
 		 231 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  36.02 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.9 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 245 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 245 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  35.17 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  35.17 
 
 		 242 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  35.19 
 
 		 233 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  33.9 
 
 		 242 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 		 216 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 		 216 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.29 
 
 		 212 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 215 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  32.64 
 
 		 227 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 245 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.98 
 
 		 217 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.62 
 
 		 229 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.84 
 
 		 223 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.84 
 
 		 223 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.09 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 230 aa  95.9  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  40.14 
 
 		 244 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.05 
 
 		 228 aa  92  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  38.03 
 
 		 236 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  32.24 
 
 		 233 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  32.24 
 
 		 233 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  31.69 
 
 		 233 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  32.24 
 
 		 233 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  31.69 
 
 		 233 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  31.69 
 
 		 233 aa  89.7  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  31.69 
 
 		 233 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.31 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  31.69 
 
 		 233 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  37.23 
 
 		 267 aa  89.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  31.69 
 
 		 233 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0473  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  30.73 
 
 		 248 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3054  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.67 
 
 		 237 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1716  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  30.73 
 
 		 248 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00444869  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  40.29 
 
 		 240 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  29.55 
 
 		 229 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  28.05 
 
 		 237 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.39 
 
 		 231 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 240 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  34.25 
 
 		 230 aa  88.2  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3767  response regulator receiver protein  37.21 
 
 		 124 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0858272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3012  two component transcriptional regulator  41.86 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  32.64 
 
 		 230 aa  87.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1839  two component transcriptional regulator  30.16 
 
 		 255 aa  87.4  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.1183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  33.16 
 
 		 233 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  33.15 
 
 		 233 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1641  two component transcriptional regulator  34.87 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.0712727 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 227 aa  87  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2613  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.52 
 
 		 242 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2245  two component transcriptional regulator  39.23 
 
 		 233 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  33.7 
 
 		 229 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 233 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 239 aa  86.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  28.25 
 
 		 1384 aa  86.3  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0415  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  34.84 
 
 		 478 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.855382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  34.11 
 
 		 252 aa  86.3  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.46 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 235 aa  85.9  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5048  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  34.84 
 
 		 478 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0352  nitrogen regulation protein NR(I)  34.84 
 
 		 478 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5101  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  34.84 
 
 		 478 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  27.78 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  33.88 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  39.37 
 
 		 238 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  37.31 
 
 		 241 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  33.88 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  33.88 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 235 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  33.88 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4822  helix-turn-helix, Fis-type:nitrogen regulation protein NR(I)  34.84 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.81 
 
 		 227 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.42 
 
 		 230 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000280381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0339  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  38.06 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  33.88 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4923  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  34.84 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.924842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 1390 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  33.88 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  39.37 
 
 		 238 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.67 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  31.39 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  31.39 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  33.88 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2748  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 		 233 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>