More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1839 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1839  two component transcriptional regulator  100 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.1183  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14041  two-component response regulator  83.4 
 
 
241 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  54.47 
 
 
241 aa  257  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  53.45 
 
 
240 aa  255  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  54.04 
 
 
241 aa  254  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  53.39 
 
 
241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0654  two component transcriptional regulator  58.26 
 
 
244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  53.62 
 
 
241 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  53.62 
 
 
241 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  53.62 
 
 
241 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  53.62 
 
 
241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  53.62 
 
 
241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  53.62 
 
 
241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  53.62 
 
 
241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  52.34 
 
 
241 aa  251  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  52.97 
 
 
241 aa  251  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  52.59 
 
 
240 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  53.62 
 
 
241 aa  249  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  52.79 
 
 
243 aa  249  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  53.19 
 
 
241 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  52.34 
 
 
240 aa  250  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05120  osmolarity response regulator  53.25 
 
 
246 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  52.72 
 
 
240 aa  249  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0359  osmolarity response regulator  52.38 
 
 
245 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  52.84 
 
 
257 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  53.59 
 
 
244 aa  245  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2311  two component transcriptional regulator  57.38 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5728  two component transcriptional regulator  56.22 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1789  two component transcriptional regulator  57.38 
 
 
241 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2405  two component transcriptional regulator  57.38 
 
 
241 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343281  normal  0.0119317 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2446  two component transcriptional regulator  57.38 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2401  two component transcriptional regulator  57.38 
 
 
241 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  53.59 
 
 
243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  50.21 
 
 
239 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2160  two component transcriptional regulator  57.33 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71041  hitchhiker  0.000000282055 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0889  two component transcriptional regulator  57.14 
 
 
305 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.147318 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1094  DNA-binding response regulator  56.96 
 
 
241 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1252  DNA-binding response regulator OmpR  56.96 
 
 
241 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1099  DNA-binding response regulator  56.96 
 
 
241 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662709  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0258  osmolarity response regulator  51.52 
 
 
246 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3387  two component transcriptional regulator  57.33 
 
 
241 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1125  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.33 
 
 
241 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  50.42 
 
 
239 aa  239  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0328  DNA-binding response regulator OmpR  51.52 
 
 
246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  52.74 
 
 
243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0893  DNA-binding response regulator OmpR  56.12 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  53.16 
 
 
245 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  50 
 
 
239 aa  239  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5944  osmolarity response regulator  51.45 
 
 
247 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68700  osmolarity response regulator  51.45 
 
 
247 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0260  osmolarity response regulator  51.08 
 
 
246 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.948807  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0204  osmolarity response regulator  49.37 
 
 
239 aa  238  6.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  53.59 
 
 
243 aa  238  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1368  osmolarity response regulator  54.72 
 
 
240 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  49.15 
 
 
240 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  52.74 
 
 
245 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1947  osmolarity response regulator  54.72 
 
 
240 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0246  osmolarity response regulator  49.35 
 
 
246 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0521802  normal  0.0191352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0261  osmolarity response regulator  49.35 
 
 
246 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  52.74 
 
 
243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  52.74 
 
 
243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  52.32 
 
 
243 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1648  osmolarity response regulator  54.46 
 
 
240 aa  234  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1898  osmolarity response regulator  54.46 
 
 
240 aa  234  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal  0.515659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1569  osmolarity response regulator  54.46 
 
 
240 aa  234  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306137  normal  0.101265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4966  osmolarity response regulator  48.92 
 
 
246 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196418 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1962  osmolarity response regulator  54.46 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187967  normal  0.0634815 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1485  osmolarity response regulator  54.46 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.021777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3325  osmolarity response regulator  53.31 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000316731  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1853  osmolarity response regulator  53.31 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00101518  hitchhiker  0.0000149756 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2507  osmolarity response regulator  54.46 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5249  osmolarity response regulator  54.46 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2094  osmolarity response regulator  54.46 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2395  osmolarity response regulator  53.31 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6141  osmolarity response regulator  54.46 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1926  osmolarity response regulator  53.31 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1938  osmolarity response regulator  54.46 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1980  osmolarity response regulator  53.31 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0224779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>