More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2418 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  56.6 
 
 		 244 aa  258  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  55.42 
 
 		 246 aa  254  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  55.42 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  55.42 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.42 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  55 
 
 		 246 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  55.08 
 
 		 245 aa  251  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  56.49 
 
 		 247 aa  251  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.56 
 
 		 247 aa  251  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.39 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  54.94 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.17 
 
 		 246 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  54.66 
 
 		 246 aa  248  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.42 
 
 		 247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 246 aa  244  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.56 
 
 		 256 aa  244  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  54.13 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 246 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 246 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  54.17 
 
 		 246 aa  241  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.31 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  53.16 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  53.14 
 
 		 245 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.62 
 
 		 275 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.61 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  52.54 
 
 		 241 aa  235  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  52.81 
 
 		 239 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  52.36 
 
 		 236 aa  234  9e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 		 243 aa  232  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  53.45 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  52.16 
 
 		 243 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  48.93 
 
 		 245 aa  228  7e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  51.27 
 
 		 242 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  48.93 
 
 		 245 aa  228  9e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  52.32 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  52.74 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  52.32 
 
 		 241 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1936  two-component response regulator GltR  51.27 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  51.9 
 
 		 260 aa  224  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 		 239 aa  224  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.63 
 
 		 245 aa  224  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  51.05 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  48.93 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  50.21 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  50.85 
 
 		 235 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  51.32 
 
 		 243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.65 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.8 
 
 		 259 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  50.65 
 
 		 262 aa  221  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  51.8 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  51.06 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  48.48 
 
 		 243 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  51.75 
 
 		 243 aa  218  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  51.35 
 
 		 242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  47.5 
 
 		 250 aa  218  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  53.28 
 
 		 243 aa  218  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  52.19 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  52.19 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  52.4 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.75 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.52 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  51.75 
 
 		 243 aa  214  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 236 aa  214  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.95 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  48.09 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 244 aa  213  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  49.36 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  48.96 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  49.15 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  49.15 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.15 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 245 aa  210  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  47.08 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2497  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 239 aa  207  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  48.51 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  48.73 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  48.51 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  51.09 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  48.51 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  48.73 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  48.09 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  49.57 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  48.09 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 241 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  47.86 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>