More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1511 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  508  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  52.89 
 
 		 243 aa  255  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.75 
 
 		 275 aa  255  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.22 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  53.19 
 
 		 246 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  53.19 
 
 		 246 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  51.67 
 
 		 246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  52.77 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  51.67 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  51.61 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  49.8 
 
 		 245 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.79 
 
 		 246 aa  238  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  49.38 
 
 		 246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  48.59 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.42 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  48.59 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  48.78 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  48.55 
 
 		 246 aa  232  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  48.59 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.38 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.64 
 
 		 242 aa  229  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  50.41 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.07 
 
 		 239 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  48.93 
 
 		 243 aa  229  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  48.28 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.28 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.55 
 
 		 246 aa  228  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.84 
 
 		 240 aa  228  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  48.72 
 
 		 251 aa  228  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  48.31 
 
 		 246 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.91 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  47.72 
 
 		 241 aa  226  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  48.93 
 
 		 236 aa  224  9e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  44.17 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  44.17 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  47.72 
 
 		 245 aa  222  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.96 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  53.18 
 
 		 218 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  50.84 
 
 		 270 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  49.16 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.36 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  47.5 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  47.08 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  46.12 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.8 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 240 aa  214  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 		 237 aa  214  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  45.27 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  46.41 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 241 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  48.91 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.91 
 
 		 259 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  45.8 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  47.84 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.53 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 		 242 aa  208  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.21 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  44.9 
 
 		 241 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  43.09 
 
 		 244 aa  205  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  46.91 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  45.23 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  44.81 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.28 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  42.86 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  42.68 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  44.4 
 
 		 242 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 240 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  44.1 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1936  two-component response regulator GltR  44.4 
 
 		 242 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.77 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  44.49 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  42.98 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  45.65 
 
 		 243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0771  two component transcriptional regulator  46.25 
 
 		 244 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.132718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  45.65 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  41.98 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.86 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>