More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2739 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  100 
 
 
241 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  59.17 
 
 
237 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  51.64 
 
 
243 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.84 
 
 
236 aa  246  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 
246 aa  242  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.22 
 
 
256 aa  241  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.44 
 
 
275 aa  241  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.02 
 
 
240 aa  235  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.07 
 
 
240 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 
240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.02 
 
 
241 aa  234  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.97 
 
 
246 aa  235  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  53.02 
 
 
241 aa  234  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  47.7 
 
 
245 aa  234  9e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.17 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  47.7 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  51.71 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  46.81 
 
 
243 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 
246 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 
246 aa  232  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.17 
 
 
246 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 
246 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 
246 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 
246 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  48.73 
 
 
247 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0297  two component transcriptional regulator  51.71 
 
 
240 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  48.33 
 
 
246 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  48.32 
 
 
236 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  48.75 
 
 
246 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  48.33 
 
 
246 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  48.33 
 
 
246 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  48.1 
 
 
241 aa  228  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  228  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  51.28 
 
 
239 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 
245 aa  228  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  228  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.54 
 
 
246 aa  228  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.28 
 
 
239 aa  227  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  227  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.15 
 
 
251 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  227  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  227  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  227  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  227  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  227  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 
245 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
239 aa  226  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 
241 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  50.85 
 
 
239 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  47.72 
 
 
250 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  50.85 
 
 
239 aa  225  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  51.5 
 
 
241 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  50.85 
 
 
239 aa  225  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  51.5 
 
 
241 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  51.5 
 
 
241 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  48.36 
 
 
247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  51.93 
 
 
241 aa  224  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  51.93 
 
 
241 aa  224  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  51.5 
 
 
241 aa  224  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  51.5 
 
 
241 aa  224  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.67 
 
 
259 aa  224  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  48.67 
 
 
230 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0271  winged helix family two component transcriptional regulator  51.75 
 
 
239 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  51.5 
 
 
241 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.95 
 
 
239 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  47.92 
 
 
246 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0287  two component transcriptional regulator  51.3 
 
 
239 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  51.07 
 
 
241 aa  222  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.52 
 
 
247 aa  222  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  51.05 
 
 
243 aa  221  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  50.63 
 
 
240 aa  221  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  47.08 
 
 
245 aa  221  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  47.08 
 
 
246 aa  221  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.46 
 
 
247 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  47.08 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  50.64 
 
 
241 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  51.07 
 
 
241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 
261 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  47.9 
 
 
236 aa  219  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
240 aa  219  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  49.79 
 
 
240 aa  219  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  51.53 
 
 
240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 
242 aa  218  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  50.42 
 
 
239 aa  218  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  50.42 
 
 
239 aa  218  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  50.64 
 
 
241 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  50.64 
 
 
241 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  49.79 
 
 
240 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>