More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2223 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 230 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  99.13 
 
 		 259 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  87.83 
 
 		 242 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  69.7 
 
 		 243 aa  328  4e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  61.4 
 
 		 252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  60.26 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  58.62 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.08 
 
 		 275 aa  251  6e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  56.47 
 
 		 248 aa  241  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  55.51 
 
 		 243 aa  241  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.27 
 
 		 256 aa  241  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  55.7 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  55.7 
 
 		 246 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  55.7 
 
 		 246 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  55.22 
 
 		 246 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  55.22 
 
 		 246 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  54.78 
 
 		 246 aa  237  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  56.14 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  55.65 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  55.22 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  55.65 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  54.78 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  54.78 
 
 		 246 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.78 
 
 		 246 aa  234  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.95 
 
 		 246 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  56.58 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  54.87 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.95 
 
 		 247 aa  232  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  55.7 
 
 		 246 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  55.26 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.48 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.8 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.51 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  51.54 
 
 		 242 aa  228  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  50 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.71 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  50 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  53.36 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 246 aa  223  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  53.28 
 
 		 241 aa  223  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.28 
 
 		 241 aa  223  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 251 aa  223  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  51.56 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  54.19 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.4 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.11 
 
 		 240 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  51.8 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.63 
 
 		 242 aa  220  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  51.75 
 
 		 243 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  52.63 
 
 		 241 aa  218  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  51.56 
 
 		 262 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.65 
 
 		 251 aa  215  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 243 aa  215  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  49.34 
 
 		 242 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 240 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.68 
 
 		 239 aa  214  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  49.34 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.78 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 237 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  51.35 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1936  two-component response regulator GltR  49.34 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.9 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  54.9 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 241 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  52.65 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  47.32 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 249 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 250 aa  210  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 260 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0297  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  47.84 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 247 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.81 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  47.81 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  47.81 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  47.81 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  47.81 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  47.81 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  47.81 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  47.81 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  47.81 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  47.81 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  47.81 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  47.81 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>