More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7106 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  59.17 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  52.54 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.65 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  50.63 
 
 		 246 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.67 
 
 		 275 aa  228  6e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  50.63 
 
 		 246 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.21 
 
 		 246 aa  225  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  50.42 
 
 		 246 aa  225  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  53.45 
 
 		 247 aa  224  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.86 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.93 
 
 		 239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  50 
 
 		 246 aa  218  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  50.86 
 
 		 246 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  49.14 
 
 		 246 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  50.86 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.57 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 246 aa  215  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  48.05 
 
 		 243 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.78 
 
 		 259 aa  214  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.73 
 
 		 246 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 230 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.58 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  47.5 
 
 		 248 aa  211  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  48.47 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  48.71 
 
 		 252 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  48.75 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.5 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0297  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.19 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  47.19 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 236 aa  208  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 242 aa  207  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0287  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 239 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0271  winged helix family two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195642 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  43.83 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  43.83 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  51.18 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 		 240 aa  198  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 261 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.02 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.34 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  48.71 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  42.67 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 253 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 245 aa  189  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  47.01 
 
 		 244 aa  188  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  42.13 
 
 		 236 aa  187  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  46.84 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  45.26 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  48.72 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  45.45 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  45.45 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  45.15 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  43.4 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  44.83 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  44.83 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  44.83 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  44.59 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  44.73 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  44.73 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  44.83 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.46 
 
 		 245 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>