More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3326 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  100 
 
 
243 aa  481  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  80.17 
 
 
261 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  60 
 
 
243 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  61.14 
 
 
242 aa  277  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  60.26 
 
 
259 aa  271  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  60.26 
 
 
230 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  55.13 
 
 
252 aa  260  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.28 
 
 
275 aa  242  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  55.13 
 
 
248 aa  238  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  52.14 
 
 
245 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  51.74 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  51.3 
 
 
246 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  51.3 
 
 
246 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  51.3 
 
 
246 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  52.77 
 
 
246 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.88 
 
 
246 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 
246 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  51.74 
 
 
246 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  50 
 
 
245 aa  228  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 
246 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  52.16 
 
 
246 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.97 
 
 
247 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  52.16 
 
 
246 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  51.97 
 
 
247 aa  225  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.15 
 
 
246 aa  224  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  51.72 
 
 
246 aa  224  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  52.16 
 
 
246 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  52.16 
 
 
246 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.72 
 
 
246 aa  223  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.66 
 
 
246 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.58 
 
 
256 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.72 
 
 
247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 
236 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 
241 aa  214  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  49.59 
 
 
240 aa  211  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  47.48 
 
 
241 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  47.88 
 
 
243 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  48.95 
 
 
239 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  48.47 
 
 
237 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  48.93 
 
 
232 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 
242 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  48.56 
 
 
262 aa  208  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 
239 aa  208  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.46 
 
 
242 aa  207  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  47.23 
 
 
240 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 
244 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 
236 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 
246 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.72 
 
 
245 aa  205  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 
240 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 
245 aa  204  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 
237 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  52.38 
 
 
218 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003939  TorCAD operon transcriptional regulatory protein TorR  44.44 
 
 
236 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0753413  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 
241 aa  201  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.17 
 
 
246 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  47.84 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.78 
 
 
239 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  46.22 
 
 
241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 
241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  45.92 
 
 
241 aa  197  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  46.09 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01583  DNA-binding transcriptional regulator TorR  42.98 
 
 
237 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 
240 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  44 
 
 
240 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0094  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 
246 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.04 
 
 
236 aa  193  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  48.47 
 
 
243 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  44.78 
 
 
241 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  44.78 
 
 
239 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  46.52 
 
 
239 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  44.78 
 
 
239 aa  191  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  46.52 
 
 
239 aa  191  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  44.78 
 
 
239 aa  191  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 
249 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  44.78 
 
 
239 aa  191  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 
232 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 
232 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 
239 aa  190  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  44.35 
 
 
239 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  44.35 
 
 
239 aa  190  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  44.35 
 
 
239 aa  190  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  44.35 
 
 
239 aa  190  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  44.35 
 
 
239 aa  190  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  44.35 
 
 
239 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  44.35 
 
 
239 aa  190  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 
239 aa  190  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  44.35 
 
 
239 aa  190  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  48.48 
 
 
257 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  44.35 
 
 
239 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  44.35 
 
 
239 aa  190  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  44.35 
 
 
239 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  44.35 
 
 
239 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  44.35 
 
 
239 aa  190  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  44.54 
 
 
239 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  44.54 
 
 
239 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.58 
 
 
263 aa  190  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  44.35 
 
 
239 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  44.35 
 
 
239 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>