More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1190 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  100 
 
 
248 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  76.73 
 
 
246 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  75.1 
 
 
246 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  75.1 
 
 
246 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  75.31 
 
 
246 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  75.72 
 
 
246 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  75.72 
 
 
246 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.49 
 
 
246 aa  359  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  70.37 
 
 
247 aa  344  8e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.83 
 
 
246 aa  340  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.16 
 
 
246 aa  339  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  68.91 
 
 
246 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.35 
 
 
246 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  68.49 
 
 
246 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  68.49 
 
 
246 aa  334  7e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  68.49 
 
 
246 aa  334  7e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  68.88 
 
 
245 aa  333  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.39 
 
 
247 aa  332  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  68.07 
 
 
246 aa  331  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  68.91 
 
 
246 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  66.94 
 
 
247 aa  329  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  68.49 
 
 
245 aa  328  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.45 
 
 
256 aa  328  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  68.49 
 
 
246 aa  325  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  75.81 
 
 
218 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  57.26 
 
 
243 aa  259  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 
275 aa  258  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  54.43 
 
 
242 aa  247  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  57.33 
 
 
242 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  55.98 
 
 
259 aa  241  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  56.47 
 
 
230 aa  241  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  53.16 
 
 
237 aa  240  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  55.13 
 
 
243 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  54.58 
 
 
243 aa  237  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  49.17 
 
 
243 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  49.39 
 
 
245 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.42 
 
 
251 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  49.39 
 
 
245 aa  236  4e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.32 
 
 
240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 
261 aa  234  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.32 
 
 
241 aa  234  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  55.32 
 
 
241 aa  234  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  51.25 
 
 
236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  51.87 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  52.07 
 
 
240 aa  232  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  55.51 
 
 
241 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.04 
 
 
236 aa  231  9e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.3 
 
 
239 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  50.41 
 
 
250 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.78 
 
 
242 aa  229  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  51.88 
 
 
251 aa  228  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  50.63 
 
 
236 aa  228  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  50.42 
 
 
261 aa  228  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  50.63 
 
 
237 aa  228  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  50.42 
 
 
260 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  53.56 
 
 
262 aa  224  8e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  50 
 
 
241 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  49.17 
 
 
241 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  50.41 
 
 
246 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  50 
 
 
241 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  51.45 
 
 
247 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 
240 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  48.31 
 
 
242 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1936  two-component response regulator GltR  48.31 
 
 
242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  46.84 
 
 
241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.19 
 
 
240 aa  218  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  48.54 
 
 
252 aa  218  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  48.32 
 
 
243 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  47.06 
 
 
241 aa  218  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 
236 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  45.93 
 
 
245 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  45.97 
 
 
241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.93 
 
 
245 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  52.1 
 
 
245 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  48.52 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  49.8 
 
 
270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  47.5 
 
 
237 aa  211  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  45.71 
 
 
241 aa  209  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.09 
 
 
240 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  47.54 
 
 
244 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  51.48 
 
 
261 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 
239 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  47.83 
 
 
230 aa  206  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
243 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  49.39 
 
 
238 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  44.81 
 
 
238 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  48.07 
 
 
239 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  48.54 
 
 
240 aa  205  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  48.54 
 
 
240 aa  205  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  48.31 
 
 
244 aa  205  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 
244 aa  205  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.63 
 
 
246 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  46.84 
 
 
243 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 
244 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 
232 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.92 
 
 
246 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  48.31 
 
 
249 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  47.26 
 
 
243 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  47.26 
 
 
243 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>