More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1299 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 242 aa  479  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.78 
 
 		 256 aa  268  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  56.28 
 
 		 243 aa  248  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.07 
 
 		 275 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.89 
 
 		 246 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  55.74 
 
 		 246 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  55.74 
 
 		 246 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  55.74 
 
 		 246 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  54.58 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.47 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2909  two component transcriptional regulator  60.34 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.999783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  55.74 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  55.04 
 
 		 245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  53.62 
 
 		 245 aa  234  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  55.83 
 
 		 246 aa  234  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  54.11 
 
 		 242 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.54 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.62 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  55.56 
 
 		 261 aa  231  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.62 
 
 		 246 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.38 
 
 		 236 aa  231  7.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  54.81 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  54.47 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  54.04 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 		 250 aa  229  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  54.81 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  53.62 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  53.78 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  55.9 
 
 		 242 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  52.72 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  55.07 
 
 		 259 aa  222  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  54.63 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.63 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  50.42 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  52.16 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  48.5 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  51.75 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  48.95 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  48.07 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  48.51 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  52.99 
 
 		 238 aa  211  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 240 aa  211  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  50.86 
 
 		 240 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  56.4 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  48.5 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.31 
 
 		 239 aa  209  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  51.46 
 
 		 243 aa  207  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  46.89 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.58 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  47.21 
 
 		 236 aa  205  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 239 aa  204  9e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  47.23 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  47.72 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  48.54 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  45.92 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.72 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  48.09 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0297  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 239 aa  201  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  47.92 
 
 		 247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  47.44 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  50.83 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  46.55 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 252 aa  198  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  49.17 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 241 aa  197  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0271  winged helix family two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.16 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0287  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  46.12 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  48.51 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  46.98 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  46.61 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  46.38 
 
 		 240 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  46.38 
 
 		 240 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  46.86 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.26 
 
 		 235 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  49.57 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.13 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  46.12 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  46.12 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>