More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3772 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  100 
 
 
241 aa  474  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
241 aa  474  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  97.91 
 
 
240 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  83.76 
 
 
251 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  80 
 
 
251 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  78.39 
 
 
241 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  65.09 
 
 
246 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  65.52 
 
 
240 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.93 
 
 
240 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  62.82 
 
 
249 aa  287  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  56.3 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  56.3 
 
 
245 aa  271  8.000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  55.36 
 
 
236 aa  271  8.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.3 
 
 
239 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  58.62 
 
 
261 aa  259  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  56.6 
 
 
262 aa  256  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  60.43 
 
 
238 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.85 
 
 
275 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.17 
 
 
256 aa  248  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  54.04 
 
 
239 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.84 
 
 
246 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.38 
 
 
246 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  57.26 
 
 
246 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  53.88 
 
 
241 aa  245  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  56.41 
 
 
246 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  56.41 
 
 
246 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  55.79 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  55.98 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  55.56 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  55.98 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  55.98 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.71 
 
 
246 aa  242  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 
237 aa  242  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  54.98 
 
 
246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  54.98 
 
 
246 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  54.98 
 
 
246 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.28 
 
 
246 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  54.98 
 
 
247 aa  239  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  54.98 
 
 
246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  54.11 
 
 
246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  54.98 
 
 
246 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  52.54 
 
 
242 aa  238  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  51.88 
 
 
243 aa  238  9e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 
246 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  55.56 
 
 
245 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.56 
 
 
246 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  55.74 
 
 
240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  55.74 
 
 
240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  53.02 
 
 
241 aa  234  6e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  55.32 
 
 
248 aa  234  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 
236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.48 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 
241 aa  232  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 
240 aa  232  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  52.61 
 
 
255 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  52.81 
 
 
245 aa  229  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  52.36 
 
 
243 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 
250 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  52.79 
 
 
270 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  52.34 
 
 
238 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.23 
 
 
236 aa  227  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.77 
 
 
247 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 
239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  54.82 
 
 
239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  48.89 
 
 
236 aa  224  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.28 
 
 
259 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  53.28 
 
 
230 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  48.26 
 
 
238 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  51.85 
 
 
243 aa  221  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  49.17 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  51.06 
 
 
240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0207  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.77 
 
 
262 aa  218  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00814931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  53.19 
 
 
261 aa  218  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  51.44 
 
 
243 aa  218  6e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  51.44 
 
 
243 aa  218  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  56.67 
 
 
218 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  51.85 
 
 
243 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  48.09 
 
 
241 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  50.65 
 
 
243 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  48.56 
 
 
253 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  51.04 
 
 
243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  51.24 
 
 
244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  47.83 
 
 
238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  51.27 
 
 
241 aa  214  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.58 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  50.85 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  51.97 
 
 
242 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  50.85 
 
 
241 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  50.85 
 
 
241 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  49.79 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  50 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  50 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  46.89 
 
 
244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  50 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  50 
 
 
241 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  50.42 
 
 
241 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0771  two component transcriptional regulator  51.93 
 
 
244 aa  211  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.132718 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  50.22 
 
 
240 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>