More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2286 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  100 
 
 
241 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  53.78 
 
 
245 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.75 
 
 
245 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  47.92 
 
 
243 aa  239  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  51.67 
 
 
244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  51.65 
 
 
243 aa  238  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.58 
 
 
246 aa  235  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  52.54 
 
 
237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  51.65 
 
 
243 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  50.63 
 
 
260 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  50.63 
 
 
241 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.91 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  51.05 
 
 
241 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  49.58 
 
 
242 aa  231  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.33 
 
 
246 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  49.36 
 
 
247 aa  231  9e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.36 
 
 
246 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1936  two-component response regulator GltR  49.58 
 
 
242 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  51.05 
 
 
241 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.13 
 
 
247 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.08 
 
 
275 aa  228  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  51.05 
 
 
235 aa  225  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  48.09 
 
 
246 aa  225  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  48.09 
 
 
245 aa  224  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 
246 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 
246 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 
246 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  47.23 
 
 
245 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 
246 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 
246 aa  222  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  47.23 
 
 
246 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 
246 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  47.08 
 
 
246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  47.23 
 
 
246 aa  221  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  47.23 
 
 
246 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  47.23 
 
 
246 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.28 
 
 
247 aa  221  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  47.23 
 
 
246 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 
239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  46.81 
 
 
246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  44.44 
 
 
245 aa  218  5e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  44.44 
 
 
245 aa  218  5e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 
248 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.09 
 
 
241 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  48.09 
 
 
241 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  45.15 
 
 
240 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 
240 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  44.92 
 
 
243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.07 
 
 
240 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.95 
 
 
246 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 
251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 
240 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 
240 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.19 
 
 
236 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 
251 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 
262 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 
246 aa  208  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.87 
 
 
236 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  47.28 
 
 
245 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 
238 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  45.57 
 
 
241 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 
242 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 
240 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 
241 aa  205  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  42.56 
 
 
240 aa  204  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  42.44 
 
 
239 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.87 
 
 
239 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  42.5 
 
 
239 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.92 
 
 
242 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  42.5 
 
 
239 aa  203  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  41.42 
 
 
241 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 
261 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  43.28 
 
 
236 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.35 
 
 
259 aa  201  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  42.98 
 
 
257 aa  201  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 
242 aa  201  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  43.16 
 
 
245 aa  201  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  43.91 
 
 
230 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  45.19 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  43.35 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  41.38 
 
 
243 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  41.77 
 
 
243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
250 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  41.18 
 
 
243 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0204  osmolarity response regulator  41.67 
 
 
239 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  42.8 
 
 
239 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  42.15 
 
 
244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 
239 aa  198  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  42.02 
 
 
243 aa  198  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  42.98 
 
 
243 aa  198  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  42.67 
 
 
245 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  42.44 
 
 
241 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  42.8 
 
 
241 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  41.6 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  41.6 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  41.18 
 
 
243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  41.77 
 
 
239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  41.77 
 
 
239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>