More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1631 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 275 aa  545  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.99 
 
 		 256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  60.16 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.83 
 
 		 246 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  61.09 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.85 
 
 		 246 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  59.41 
 
 		 247 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  58.44 
 
 		 245 aa  278  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  58.85 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.26 
 
 		 247 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  58.85 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  58.85 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  58.06 
 
 		 246 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  58.85 
 
 		 246 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  59.26 
 
 		 245 aa  274  9e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.61 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  59.5 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  58.44 
 
 		 246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  58.02 
 
 		 246 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  57.54 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  59.04 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  59.04 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  58.06 
 
 		 246 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.85 
 
 		 246 aa  268  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  56.38 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  57.26 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.38 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.96 
 
 		 239 aa  259  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 		 248 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  57.2 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  53.75 
 
 		 250 aa  255  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  51.85 
 
 		 245 aa  252  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  54.24 
 
 		 252 aa  251  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  58.08 
 
 		 230 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  51.85 
 
 		 245 aa  251  8.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  57.64 
 
 		 259 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  57.85 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.88 
 
 		 236 aa  250  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  54.85 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.85 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.72 
 
 		 240 aa  248  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  50.21 
 
 		 236 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  52.52 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  54.01 
 
 		 242 aa  246  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  56.33 
 
 		 242 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.07 
 
 		 242 aa  244  8e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  52.28 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  51.44 
 
 		 241 aa  241  7e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 		 261 aa  241  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  53.91 
 
 		 240 aa  241  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  53.11 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  57.74 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.53 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  53.75 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  58.48 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.17 
 
 		 240 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  53.62 
 
 		 237 aa  238  8e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  54.36 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  51.06 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  53.11 
 
 		 240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.21 
 
 		 239 aa  235  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  53.69 
 
 		 247 aa  235  7e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  54.47 
 
 		 238 aa  234  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  51.05 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 		 239 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 237 aa  229  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  47.08 
 
 		 241 aa  228  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  51.67 
 
 		 237 aa  228  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  51.25 
 
 		 245 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  49.8 
 
 		 245 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  50.83 
 
 		 244 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  53.53 
 
 		 270 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  46.89 
 
 		 238 aa  225  7e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 240 aa  225  7e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 240 aa  225  7e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  56.36 
 
 		 239 aa  224  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  52.12 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  50.62 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.26 
 
 		 246 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  53.53 
 
 		 238 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 241 aa  221  8e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  46.47 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  51.27 
 
 		 249 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 240 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 241 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0771  two component transcriptional regulator  50.2 
 
 		 244 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.132718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  48.95 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.16 
 
 		 253 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2983  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000906081  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2497  two component transcriptional regulator  51.27 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  48.12 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.4 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.53 
 
 		 245 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 		 243 aa  208  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  45.42 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>