More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3731 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  60.52 
 
 		 241 aa  285  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  59.83 
 
 		 255 aa  279  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  51.44 
 
 		 251 aa  258  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  53.45 
 
 		 240 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.62 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  51.05 
 
 		 246 aa  248  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  52.08 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.38 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.38 
 
 		 240 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  52.38 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.65 
 
 		 240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  46.84 
 
 		 245 aa  234  7e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  46.41 
 
 		 245 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  48.75 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.26 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 238 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 249 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  47.9 
 
 		 241 aa  214  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.92 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.44 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  41.95 
 
 		 241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.44 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  45.9 
 
 		 243 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  45.02 
 
 		 236 aa  211  5.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  46.47 
 
 		 245 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 246 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 246 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 239 aa  208  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  42.21 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 243 aa  205  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.68 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  45.13 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  42.21 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5497  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  43.29 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  47.35 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.35 
 
 		 259 aa  201  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 245 aa  201  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 243 aa  201  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.67 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.68 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  44.73 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 		 245 aa  198  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  42.26 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 270 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 246 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 246 aa  195  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  42.86 
 
 		 247 aa  195  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  42.39 
 
 		 252 aa  194  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.4 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 246 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0207  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.34 
 
 		 262 aa  192  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00814931  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  45.3 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0771  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.132718 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.21 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  45.3 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  43.1 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  41.35 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  44.35 
 
 		 239 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  44.35 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  41.22 
 
 		 247 aa  188  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  44.35 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  44.44 
 
 		 243 aa  188  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  44.44 
 
 		 243 aa  188  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 243 aa  188  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.51 
 
 		 242 aa  187  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  41.35 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  43.88 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  49.47 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>