More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5497 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5497  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 219 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 246 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  47.03 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  45.41 
 
 		 255 aa  188  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.85 
 
 		 240 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  46.6 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  47.25 
 
 		 241 aa  174  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 241 aa  174  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 240 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  46.97 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  42.79 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  42.79 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.97 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  40.31 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 275 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  42.56 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.23 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  40.47 
 
 		 245 aa  151  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.62 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  42.63 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 239 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 250 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  44.27 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  42.64 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 261 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 240 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  41.12 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  41.54 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5596  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 235 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  39.42 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  36.77 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  38.27 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  43.92 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  43.92 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  39.27 
 
 		 238 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.78 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.31 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.45 
 
 		 240 aa  141  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 243 aa  141  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 245 aa  141  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  39.44 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  40.55 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  38.03 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.94 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.76 
 
 		 236 aa  138  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 238 aa  138  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 246 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  38.81 
 
 		 238 aa  138  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.75 
 
 		 248 aa  138  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 241 aa  138  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  42.16 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.7 
 
 		 246 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 246 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0577  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  40.84 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  36.87 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  37.68 
 
 		 239 aa  134  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3376  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.43 
 
 		 242 aa  134  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 237 aa  134  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  40.8 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  40.8 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  38.02 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  39.45 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  36.2 
 
 		 246 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  38.28 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0092  two component transcriptional regulator  36.77 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>