More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5596 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5596  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 235 aa  477  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1035  two component transcriptional regulator  72.8 
 
 		 246 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0283  two component transcriptional regulator  75.42 
 
 		 243 aa  340  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126158 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4102  DNA-binding response regulator  72.03 
 
 		 239 aa  332  4e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0131  two component transcriptional regulator  70.25 
 
 		 245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364585  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4024  DNA-binding response regulator  70.25 
 
 		 245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 		 241 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 239 aa  179  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 275 aa  178  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  41.77 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  41.77 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  42.68 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  41.38 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.95 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  42.13 
 
 		 241 aa  175  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 262 aa  175  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 236 aa  174  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  45.15 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 251 aa  171  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  40.69 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.25 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 239 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 250 aa  168  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  40.26 
 
 		 238 aa  165  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  40 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.34 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  42.42 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  41.81 
 
 		 236 aa  164  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 243 aa  164  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  41.13 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  38.63 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  42.8 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 238 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4385  two-component response regulator VirG  41.99 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0094  two component transcriptional regulator  41.25 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  41.08 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0207  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00814931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0710  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.77 
 
 		 235 aa  162  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.92 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1820  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.08 
 
 		 245 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2103  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0666731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  38.98 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  39.58 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  38.89 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4376  winged helix family two component transcriptional regulator  39 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  37.02 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  40.26 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3232  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  40.26 
 
 		 239 aa  158  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3376  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.85 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0359  osmolarity response regulator  39.74 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.41 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.92 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  38.46 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  38.46 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  40 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.72 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3683  two component transcriptional regulator  39.26 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.801848  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3373  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.584151  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.3 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  39.41 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>