More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0131 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0131  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364585  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4024  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 245 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4102  DNA-binding response regulator  97.55 
 
 		 239 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1035  two component transcriptional regulator  72.31 
 
 		 246 aa  363  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5596  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.25 
 
 		 235 aa  350  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0283  two component transcriptional regulator  73.36 
 
 		 243 aa  349  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126158 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  40.83 
 
 		 245 aa  187  9e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  40.83 
 
 		 245 aa  187  9e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.25 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 239 aa  184  9e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 232 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.25 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.16 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  38.59 
 
 		 236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  40.08 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.08 
 
 		 275 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0710  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 248 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  38.24 
 
 		 243 aa  171  9e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  40.93 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  39.41 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  37.39 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  40.76 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  39 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.51 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  40.5 
 
 		 241 aa  168  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  39.92 
 
 		 241 aa  168  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  40.17 
 
 		 244 aa  168  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.25 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  39.24 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0094  two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  39.58 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  39.66 
 
 		 240 aa  166  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  38.91 
 
 		 241 aa  165  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.6 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  36.97 
 
 		 238 aa  164  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  38.24 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  39.08 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3286  two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.75 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  37.92 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3683  two component transcriptional regulator  39.75 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.801848  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  39.08 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  39.08 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  37.92 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3280  two component transcriptional regulator  39.58 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  41.84 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4385  two-component response regulator VirG  39.33 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  38.56 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  38.56 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0872  DNA-binding response regulator  40.76 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359732  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  38.56 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  37.82 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4376  winged helix family two component transcriptional regulator  39.33 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0207  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.41 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00814931  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0746  DNA-binding response regulator  39.92 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1669  DNA-binding response regulator  39.92 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.501573  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0531  DNA-binding response regulator  39.92 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2121  DNA-binding response regulator  39.92 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0885999  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0602  DNA-binding response regulator  39.92 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0713  DNA-binding response regulator  39.92 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2023  DNA-binding response regulator  39.92 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  39.24 
 
 		 239 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.67 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  36.63 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1574  osmolarity response regulator  40 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2393  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.41 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2116  response regulator receiver  39.41 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  38.75 
 
 		 246 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 246 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  38.02 
 
 		 247 aa  161  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.55 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  38.82 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  38.82 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  39.33 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  35.98 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  39 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  40.82 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.27 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  38.33 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3376  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.24 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  35.95 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>