More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0872 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0872  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2121  DNA-binding response regulator  94.21 
 
 		 245 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0885999  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0602  DNA-binding response regulator  93.8 
 
 		 245 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0746  DNA-binding response regulator  93.8 
 
 		 245 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0713  DNA-binding response regulator  93.8 
 
 		 245 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0531  DNA-binding response regulator  94.21 
 
 		 245 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2023  DNA-binding response regulator  94.21 
 
 		 245 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485022  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1669  DNA-binding response regulator  93.8 
 
 		 245 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.501573  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 253 aa  201  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0328  two component transcriptional regulator  48.31 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0159166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3900  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 243 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00241  VirG  42.29 
 
 		 258 aa  182  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3905  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.8 
 
 		 243 aa  182  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4385  two-component response regulator VirG  39.57 
 
 		 241 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  40.52 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.52 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  39.08 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  42.19 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  36.82 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  39.15 
 
 		 241 aa  168  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 245 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 246 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  41.1 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  38.49 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  36.82 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.03 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3683  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.801848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0710  two component transcriptional regulator  36.1 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  41.05 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0577  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 240 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.46 
 
 		 239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1035  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.51 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.51 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  39.22 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  36.55 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  40.26 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3376  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 		 242 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  39.15 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.15 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6145  two-component response regulator VirG  38.7 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8217  two-component response regulator VirG  39.57 
 
 		 241 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.206668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 234 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 240 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  40.61 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  37.02 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4376  winged helix family two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  38.75 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.45 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  40.35 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  37.02 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>