More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4191 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  51.04 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  48.29 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  43.98 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  45.23 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  45.23 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  45.23 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  47.72 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.77 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.62 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 246 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  44.58 
 
 		 247 aa  211  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.4 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 243 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 245 aa  205  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 246 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 246 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.51 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 		 246 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.26 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 		 247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  43.39 
 
 		 241 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  44.81 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  45.42 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1874  two component transcriptional regulator  46.81 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.19 
 
 		 275 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  45.99 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  45.8 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  45.99 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.09 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  42.44 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  45.15 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  45.65 
 
 		 230 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  46.96 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 236 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  43.93 
 
 		 245 aa  191  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1333  osmolarity response regulator  48.32 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00265076  decreased coverage  0.0000710625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1962  osmolarity response regulator  48.32 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187967  normal  0.0634815 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1253  osmolarity response regulator  48.32 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.512472  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3325  osmolarity response regulator  48.32 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000316731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1980  osmolarity response regulator  48.32 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0224779  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5249  osmolarity response regulator  48.32 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2352  osmolarity response regulator  48.32 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1853  osmolarity response regulator  48.32 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00101518  hitchhiker  0.0000149756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  45.26 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6141  osmolarity response regulator  48.32 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1926  osmolarity response regulator  48.32 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1938  osmolarity response regulator  48.32 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2395  osmolarity response regulator  48.32 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1485  osmolarity response regulator  48.32 
 
 		 241 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.021777  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2507  osmolarity response regulator  48.32 
 
 		 241 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2094  osmolarity response regulator  48.32 
 
 		 241 aa  191  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3280  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 241 aa  191  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3232  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 244 aa  191  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  43.75 
 
 		 243 aa  191  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  42.06 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  45.64 
 
 		 244 aa  191  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  46.12 
 
 		 243 aa  191  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  45.53 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  43.59 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1368  osmolarity response regulator  48.73 
 
 		 240 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0634  two component transcriptional regulator  42.26 
 
 		 255 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  45.11 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0577  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1003  osmolarity response regulator  47.9 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  0.39184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1947  osmolarity response regulator  48.73 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  45.11 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  41.63 
 
 		 245 aa  189  5e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1879  osmolarity response regulator  47.9 
 
 		 244 aa  188  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.276509  normal  0.342548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0710  two component transcriptional regulator  41.49 
 
 		 248 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2307  osmolarity response regulator  47.9 
 
 		 244 aa  188  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0713504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  45.53 
 
 		 241 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  43.28 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>