More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2051 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
246 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  96.75 
 
 
246 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  84.08 
 
 
245 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  83.61 
 
 
247 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  84.3 
 
 
246 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  81.89 
 
 
246 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  80.89 
 
 
246 aa  417  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  81.89 
 
 
246 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  81.89 
 
 
246 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  83.47 
 
 
245 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  83.47 
 
 
246 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  81.89 
 
 
246 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  80.25 
 
 
246 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  78.86 
 
 
247 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.15 
 
 
246 aa  377  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  71.6 
 
 
246 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  72.02 
 
 
246 aa  364  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  71.6 
 
 
246 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  72.8 
 
 
246 aa  363  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  71.97 
 
 
246 aa  359  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  71.97 
 
 
246 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.5 
 
 
247 aa  355  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  68.16 
 
 
248 aa  339  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.72 
 
 
256 aa  338  4e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  72.51 
 
 
218 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.85 
 
 
275 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  57.92 
 
 
243 aa  271  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  56.6 
 
 
242 aa  262  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  55.42 
 
 
237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  53.94 
 
 
246 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  53.65 
 
 
243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  54.27 
 
 
236 aa  243  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  56.71 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.71 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.28 
 
 
236 aa  240  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  52.77 
 
 
236 aa  239  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.84 
 
 
240 aa  239  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  56.28 
 
 
241 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.47 
 
 
242 aa  237  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  52.74 
 
 
240 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  49.58 
 
 
241 aa  235  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  52.54 
 
 
239 aa  235  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  54.82 
 
 
242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.91 
 
 
240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.47 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  53.95 
 
 
230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.95 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  52.56 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  52.34 
 
 
236 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  49.17 
 
 
241 aa  233  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  49.38 
 
 
250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  49.38 
 
 
245 aa  231  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  49.38 
 
 
245 aa  231  6e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  50 
 
 
241 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  53.53 
 
 
240 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  50 
 
 
261 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 
239 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.08 
 
 
240 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 
260 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  53.14 
 
 
245 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 
241 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 
241 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 
243 aa  224  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
239 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  50 
 
 
237 aa  223  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  50.83 
 
 
247 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  48.29 
 
 
243 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.58 
 
 
239 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.18 
 
 
263 aa  218  7.999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  49.17 
 
 
252 aa  218  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  47.23 
 
 
240 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  48.72 
 
 
243 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  50.42 
 
 
262 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  48.29 
 
 
242 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  48.96 
 
 
249 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1936  two-component response regulator GltR  48.72 
 
 
242 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 
244 aa  216  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  51.06 
 
 
240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  51.06 
 
 
240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  46.81 
 
 
245 aa  214  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  48.55 
 
 
244 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  49.58 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  45.99 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.38 
 
 
245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  50 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  49.34 
 
 
240 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 
239 aa  211  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 
252 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  50.22 
 
 
243 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  48.07 
 
 
240 aa  209  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 
238 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 
241 aa  209  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0654  two component transcriptional regulator  51.09 
 
 
244 aa  208  8e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  48.72 
 
 
257 aa  207  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  46.38 
 
 
245 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 
244 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  46.78 
 
 
241 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>