More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5704 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  487  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  97.97 
 
 		 246 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  86.99 
 
 		 246 aa  440  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  86.99 
 
 		 246 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  89.75 
 
 		 246 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  86.99 
 
 		 246 aa  440  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  88.43 
 
 		 246 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  87.65 
 
 		 245 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  83.47 
 
 		 246 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  84.23 
 
 		 246 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  81.15 
 
 		 247 aa  410  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  82.85 
 
 		 247 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  82.99 
 
 		 246 aa  410  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  81.82 
 
 		 245 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.69 
 
 		 246 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  72.38 
 
 		 246 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  71.97 
 
 		 246 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  72.38 
 
 		 246 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  71.14 
 
 		 246 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  71.97 
 
 		 246 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  72.38 
 
 		 246 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.38 
 
 		 247 aa  350  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.31 
 
 		 256 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  68.49 
 
 		 248 aa  325  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  71.56 
 
 		 218 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  58.75 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.02 
 
 		 275 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  54.89 
 
 		 242 aa  256  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  52.5 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  54.17 
 
 		 237 aa  241  7.999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 239 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  53.42 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  54.55 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.84 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  55.84 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  49.38 
 
 		 250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.68 
 
 		 240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  52.92 
 
 		 236 aa  234  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 		 240 aa  234  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  51.26 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  51.9 
 
 		 240 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.6 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  51.52 
 
 		 251 aa  231  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 261 aa  231  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  51.71 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  55.26 
 
 		 230 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  55.26 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  49.38 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  49.38 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.62 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.64 
 
 		 240 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.5 
 
 		 239 aa  228  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 243 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  51.24 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  48.74 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.42 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.67 
 
 		 240 aa  225  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  53.07 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  47.66 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  51.46 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  51.65 
 
 		 262 aa  222  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  51.65 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  49.38 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 240 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  47.08 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  48.33 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  49.58 
 
 		 244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  48.33 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  50.86 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  51.06 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  46.47 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  51.06 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  46.69 
 
 		 253 aa  215  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 243 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  47.86 
 
 		 241 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  47.92 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  47.86 
 
 		 242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  50 
 
 		 243 aa  211  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  46.58 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  48.12 
 
 		 261 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  47.9 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  48.73 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0654  two component transcriptional regulator  52.4 
 
 		 244 aa  209  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  48.07 
 
 		 243 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1936  two-component response regulator GltR  47.44 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2497  two component transcriptional regulator  49.17 
 
 		 239 aa  208  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  46.94 
 
 		 244 aa  207  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  44.73 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  48.28 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  47.76 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  46.58 
 
 		 240 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 		 252 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  45.73 
 
 		 245 aa  204  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 241 aa  205  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>