More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5813 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  100 
 
 
253 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3900  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.99 
 
 
259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  51.88 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3905  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.28 
 
 
243 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  49.38 
 
 
251 aa  221  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0531  DNA-binding response regulator  47.88 
 
 
245 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2121  DNA-binding response regulator  47.88 
 
 
245 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0885999  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2023  DNA-binding response regulator  47.88 
 
 
245 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485022  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0746  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 
245 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0713  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 
245 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.56 
 
 
241 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0602  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 
245 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1669  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 
245 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.501573  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  48.56 
 
 
241 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  47.88 
 
 
236 aa  216  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4385  two-component response regulator VirG  50.85 
 
 
241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  51.27 
 
 
262 aa  215  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  46.69 
 
 
246 aa  215  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.5 
 
 
240 aa  214  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  46.28 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  46.28 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  47.48 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.99 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.8 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  47.72 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0872  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 
244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1874  two component transcriptional regulator  51.06 
 
 
235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  45.71 
 
 
247 aa  211  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.57 
 
 
246 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8217  two-component response regulator VirG  50.85 
 
 
241 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.206668  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.76 
 
 
248 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 
246 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.38 
 
 
245 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  44.63 
 
 
246 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 
246 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00241  VirG  47.41 
 
 
258 aa  209  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 
242 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 
250 aa  208  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.09 
 
 
246 aa  208  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  44.92 
 
 
245 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 
246 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6145  two-component response regulator VirG  46.81 
 
 
241 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 
256 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  44.92 
 
 
245 aa  206  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 
251 aa  205  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 
245 aa  205  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.77 
 
 
247 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 
246 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.82 
 
 
275 aa  205  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 
252 aa  204  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.31 
 
 
239 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 
239 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  44.03 
 
 
245 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 
244 aa  202  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  46.86 
 
 
270 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  45.23 
 
 
241 aa  201  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  46.29 
 
 
238 aa  201  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  48.75 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  45.15 
 
 
243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  44.96 
 
 
246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  44.96 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  44.96 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  44.96 
 
 
246 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  44.96 
 
 
246 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 
247 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 
232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 
232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  47.68 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 
249 aa  198  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2983  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 
242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000906081  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  45.85 
 
 
238 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 
240 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 
236 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 
240 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  44.73 
 
 
241 aa  192  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 
236 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5717  putative two-component response regulator  45.57 
 
 
245 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 
237 aa  192  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  46.49 
 
 
240 aa  192  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  41.95 
 
 
236 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  46.26 
 
 
230 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.85 
 
 
259 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  45.8 
 
 
261 aa  190  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  45.85 
 
 
240 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0710  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 
248 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65880  putative two-component response regulator  45.15 
 
 
244 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0780512  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0328  two component transcriptional regulator  47.88 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0159166  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  45.61 
 
 
239 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  45.61 
 
 
239 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  45.61 
 
 
239 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  45.61 
 
 
239 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  45.61 
 
 
239 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  45.61 
 
 
239 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  45.61 
 
 
239 aa  189  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>