More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0516 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  100 
 
 		 247 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  86.99 
 
 		 246 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  81.97 
 
 		 246 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  80.33 
 
 		 247 aa  411  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  81.15 
 
 		 246 aa  410  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  80.74 
 
 		 246 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.86 
 
 		 246 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.86 
 
 		 246 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  77.87 
 
 		 246 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  79.59 
 
 		 245 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  77.46 
 
 		 246 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  77.46 
 
 		 246 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  77.46 
 
 		 246 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  78.84 
 
 		 245 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.83 
 
 		 246 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  71.72 
 
 		 246 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  72.92 
 
 		 246 aa  359  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  72.5 
 
 		 246 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  72.5 
 
 		 246 aa  357  8e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  70.49 
 
 		 246 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  70.49 
 
 		 246 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.03 
 
 		 247 aa  349  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.34 
 
 		 256 aa  332  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  66.94 
 
 		 248 aa  329  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  72.64 
 
 		 218 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  61.51 
 
 		 243 aa  281  9e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.09 
 
 		 275 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  54.47 
 
 		 242 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  56.49 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  55.56 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.56 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.13 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 239 aa  241  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  56.09 
 
 		 241 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  51.46 
 
 		 246 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  52.77 
 
 		 236 aa  238  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.97 
 
 		 236 aa  238  8e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  53.71 
 
 		 261 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  51.91 
 
 		 251 aa  238  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.58 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  55.65 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  55.65 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.59 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  51.26 
 
 		 243 aa  235  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  49.8 
 
 		 245 aa  233  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  49.8 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  48.78 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.39 
 
 		 239 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  52.77 
 
 		 236 aa  231  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 245 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  49.36 
 
 		 241 aa  231  9e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.48 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.63 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  48.73 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  52.17 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  50.21 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  53.51 
 
 		 242 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  53.75 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  51.97 
 
 		 243 aa  225  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.42 
 
 		 239 aa  224  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 241 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  53.45 
 
 		 237 aa  224  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  52.54 
 
 		 240 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  52.54 
 
 		 240 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 243 aa  221  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  50.84 
 
 		 239 aa  221  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  50.62 
 
 		 262 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  48.95 
 
 		 243 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  52.1 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 241 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  48.94 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  47.86 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  53.25 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  49.58 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  48.15 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  48.29 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  50 
 
 		 243 aa  212  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  45.71 
 
 		 253 aa  211  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  48.07 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  48.47 
 
 		 240 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1936  two-component response regulator GltR  47.44 
 
 		 242 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  44.58 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  48.05 
 
 		 244 aa  210  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  46.38 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  48.72 
 
 		 243 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  48.72 
 
 		 243 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  49.16 
 
 		 270 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 261 aa  208  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.87 
 
 		 245 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  48.29 
 
 		 243 aa  208  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  51.72 
 
 		 238 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  48.51 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  48.97 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  48.94 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>