More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1290 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 245 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  95.51 
 
 		 245 aa  474  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  86.12 
 
 		 243 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  84.1 
 
 		 241 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  83.54 
 
 		 241 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  83.12 
 
 		 260 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  83.12 
 
 		 241 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  81.25 
 
 		 242 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1936  two-component response regulator GltR  80.83 
 
 		 242 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  80.25 
 
 		 243 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  53.78 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  51.67 
 
 		 244 aa  228  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.21 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 246 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 246 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 246 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  48.51 
 
 		 245 aa  218  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.3 
 
 		 247 aa  218  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 246 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 246 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.46 
 
 		 246 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  45.93 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.81 
 
 		 246 aa  214  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  49.34 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.34 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.38 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.38 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  46.34 
 
 		 243 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 243 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  46.38 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 246 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 242 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 246 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  45.42 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  48.51 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 246 aa  204  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.76 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  44.77 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  45.3 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  45.19 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 241 aa  201  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  45.19 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  45.19 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  44.77 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  44.77 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  45.19 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  43.93 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  44.03 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  45.42 
 
 		 241 aa  198  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  44.35 
 
 		 241 aa  198  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  43.93 
 
 		 245 aa  197  9e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  44.58 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  44.35 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  45.53 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  45 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  44.78 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  45.49 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 241 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  44.03 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 236 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  44.77 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  44.92 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.21 
 
 		 236 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  41.98 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  44.68 
 
 		 241 aa  191  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.68 
 
 		 241 aa  191  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  46.37 
 
 		 247 aa  191  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  42.68 
 
 		 240 aa  191  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  43.93 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.38 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.83 
 
 		 240 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  43.78 
 
 		 243 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  42.49 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  42.49 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  41.25 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  41.25 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  42.49 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  43.62 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  42.49 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  42.49 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  42.49 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  42.49 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  42.49 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  42.49 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>