More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2272 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 240 aa  487  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.38 
 
 		 275 aa  262  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  52.5 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.81 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  52.61 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  52.92 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  54.31 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  52.92 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.41 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.17 
 
 		 246 aa  234  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  52.08 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  52.28 
 
 		 246 aa  232  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 		 237 aa  232  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  52.08 
 
 		 246 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  52.08 
 
 		 246 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  53.48 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  47.48 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  47.48 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.08 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 		 238 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  52.5 
 
 		 246 aa  228  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 241 aa  228  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.67 
 
 		 239 aa  228  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  50.62 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  51.45 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  50.62 
 
 		 246 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  50.62 
 
 		 246 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.25 
 
 		 246 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  51.48 
 
 		 243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  51.67 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  52.16 
 
 		 261 aa  225  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  48.92 
 
 		 236 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.58 
 
 		 239 aa  224  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  50.21 
 
 		 246 aa  224  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  52.08 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  48.96 
 
 		 250 aa  222  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  48.73 
 
 		 238 aa  221  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  51.08 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  51.45 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.85 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  49.58 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  49.19 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  48.92 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  48.31 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  50.86 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.33 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.49 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  48.92 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  48.72 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.71 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 242 aa  211  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  47.39 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  46.47 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.92 
 
 		 241 aa  211  9e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  48.92 
 
 		 241 aa  211  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  45.89 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  45.69 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 245 aa  208  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  47.08 
 
 		 235 aa  208  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 244 aa  208  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  47.86 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0771  two component transcriptional regulator  50.42 
 
 		 244 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.132718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.9 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 249 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  44.44 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  44.81 
 
 		 241 aa  205  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  48.15 
 
 		 247 aa  201  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  48.09 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  48.09 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  48.89 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  48.09 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.89 
 
 		 259 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 243 aa  197  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  47.88 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  47.23 
 
 		 270 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  46.81 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  46.41 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  47.48 
 
 		 243 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  47.46 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  47.68 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1936  two-component response regulator GltR  46.81 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>