More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3219 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3781  two component transcriptional regulator  72.1 
 
 		 238 aa  306  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  64.83 
 
 		 238 aa  288  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.79 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  55.79 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.41 
 
 		 240 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0771  two component transcriptional regulator  54.24 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.132718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.7 
 
 		 251 aa  238  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  54.82 
 
 		 239 aa  238  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  54.74 
 
 		 241 aa  238  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  53.62 
 
 		 251 aa  235  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  51.49 
 
 		 241 aa  220  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  47.48 
 
 		 245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  48.05 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  51.69 
 
 		 245 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  50.44 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  47.48 
 
 		 245 aa  218  7.999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 241 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  46.69 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.9 
 
 		 246 aa  214  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  45.99 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.72 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  45.08 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  46.44 
 
 		 242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 250 aa  211  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  47.5 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  44.26 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  48.5 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  45.42 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  50.42 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  46.28 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.26 
 
 		 236 aa  204  9e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  44.58 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  48.76 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  49.16 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  44.58 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  44.58 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  48.92 
 
 		 244 aa  201  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.76 
 
 		 275 aa  201  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  47.19 
 
 		 247 aa  201  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.77 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 242 aa  201  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  46.44 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  45.13 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  46.84 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  44.98 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.8 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3566  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291783  normal  0.121657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  45.38 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  44.54 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  46.03 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 239 aa  198  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 236 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  48.23 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  44.49 
 
 		 246 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  46.03 
 
 		 241 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  45.99 
 
 		 241 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  45.99 
 
 		 241 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  44.78 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  45.9 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  47.39 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  47.39 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  43.7 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  43.28 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1368  osmolarity response regulator  49.29 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.55 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  45.19 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  44.12 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  46.96 
 
 		 243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  43.88 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  46.52 
 
 		 243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1648  osmolarity response regulator  49.29 
 
 		 240 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1569  osmolarity response regulator  49.29 
 
 		 240 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306137  normal  0.101265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1898  osmolarity response regulator  49.29 
 
 		 240 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal  0.515659 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1947  osmolarity response regulator  49.29 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  48.23 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.83 
 
 		 259 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1003  osmolarity response regulator  49.52 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  0.39184 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1853  osmolarity response regulator  49.52 
 
 		 244 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00101518  hitchhiker  0.0000149756 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2094  osmolarity response regulator  49.52 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1253  osmolarity response regulator  49.52 
 
 		 244 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.512472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>