More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04421 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  59.83 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2147  two component transcriptional regulator  57.4 
 
 		 235 aa  231  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  51.08 
 
 		 241 aa  228  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  51.3 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.99 
 
 		 239 aa  224  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  48.92 
 
 		 244 aa  218  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  46.58 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  46.58 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.23 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  46.75 
 
 		 236 aa  207  9e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.81 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 236 aa  206  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  48.5 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 245 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  47.84 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  46.12 
 
 		 243 aa  202  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 		 246 aa  201  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 		 246 aa  201  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  47.11 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 241 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  47.84 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 246 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  46.7 
 
 		 247 aa  198  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 246 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 246 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.16 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.81 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 262 aa  193  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 246 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  45.18 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 240 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  46.43 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.43 
 
 		 259 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.87 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  44.78 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 241 aa  185  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 253 aa  184  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 251 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  43.75 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3683  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.801848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  44.05 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  44.05 
 
 		 248 aa  181  7e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  44.78 
 
 		 245 aa  180  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0297  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  44.05 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  44.78 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  43.59 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  46.92 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  43.22 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>