More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2092 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 263 aa  510  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  57.61 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  56.5 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.72 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.87 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 256 aa  228  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.18 
 
 		 246 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  48.78 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  48.97 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.95 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  47.74 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  48.97 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 243 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  48.97 
 
 		 246 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  47.74 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  47.74 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  48.97 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  48.56 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  47.33 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  48.58 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.91 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.4 
 
 		 275 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  47.54 
 
 		 246 aa  208  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 240 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  47.33 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.13 
 
 		 247 aa  208  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.15 
 
 		 246 aa  208  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  45.75 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  48.36 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  49.18 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  45.08 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  46.69 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  46.53 
 
 		 246 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  46.91 
 
 		 247 aa  205  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  46.31 
 
 		 236 aa  205  7e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 247 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  45.77 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.94 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 246 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  43.77 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  48.97 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.12 
 
 		 240 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  47.2 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  46.61 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  46.03 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.93 
 
 		 240 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  44.71 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  47.54 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  45.31 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 218 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  46.31 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 241 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  44.76 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  42.74 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.13 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0771  two component transcriptional regulator  45.71 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.132718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.31 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  44.58 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  42.11 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  45.87 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  44.81 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  42.34 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  41.7 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  43.15 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 236 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.62 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  38.52 
 
 		 241 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.67 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  43.08 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  43.08 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.11 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3900  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  42.28 
 
 		 241 aa  178  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 253 aa  178  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  42.28 
 
 		 240 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  41.04 
 
 		 242 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  42.28 
 
 		 240 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  44.63 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  42.45 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  40.3 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.43 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  43.03 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2147  two component transcriptional regulator  45.64 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  42.04 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>