More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2235 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  69.58 
 
 		 240 aa  330  1e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.61 
 
 		 263 aa  267  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.79 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.42 
 
 		 244 aa  221  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 		 261 aa  211  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.42 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  46.12 
 
 		 238 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 241 aa  205  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  48.09 
 
 		 238 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  48.07 
 
 		 249 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  47.86 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.31 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 240 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  45.34 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  46.41 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.41 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  43.88 
 
 		 243 aa  201  9e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  45.69 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 241 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.96 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  42.44 
 
 		 245 aa  198  5e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 251 aa  198  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 241 aa  198  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 243 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  47.86 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  46.52 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  47.86 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  46.84 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.66 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  42.44 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.28 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.46 
 
 		 259 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  46.46 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  45.41 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.92 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  46.44 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  43.88 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 246 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  43.29 
 
 		 249 aa  188  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  45.34 
 
 		 270 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.12 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  43.03 
 
 		 247 aa  185  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  45.11 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 243 aa  185  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 		 246 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  44.77 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.26 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  43.67 
 
 		 230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1228  DNA-binding transcriptional regulator TorR  40.76 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.16 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2803  DNA-binding transcriptional regulator TorR  41.1 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2909  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 		 268 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.999783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  44.78 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.83 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  48.79 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  44.93 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1150  DNA-binding transcriptional regulator TorR  41.25 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  41.53 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  40.34 
 
 		 236 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1047  DNA-binding transcriptional regulator TorR  40.34 
 
 		 236 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.499715  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3356  DNA-binding transcriptional regulator TorR  40.34 
 
 		 236 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  40.34 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  44.35 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 245 aa  178  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1112  DNA-binding transcriptional regulator TorR  40.34 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1051  DNA-binding transcriptional regulator TorR  40.34 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3367  DNA-binding transcriptional regulator TorR  38.91 
 
 		 236 aa  177  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 244 aa  177  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>