More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5255 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  97.7 
 
 		 246 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  94.93 
 
 		 246 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  96.3 
 
 		 246 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  96.3 
 
 		 246 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  85.78 
 
 		 246 aa  374  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.53 
 
 		 246 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  75.81 
 
 		 248 aa  323  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  72.04 
 
 		 247 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  72.22 
 
 		 246 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.3 
 
 		 247 aa  317  7.999999999999999e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  71.76 
 
 		 246 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.51 
 
 		 246 aa  315  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  72.64 
 
 		 247 aa  315  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  71.76 
 
 		 246 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  72.99 
 
 		 245 aa  315  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  70.64 
 
 		 246 aa  315  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  71.56 
 
 		 246 aa  314  8e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  71.3 
 
 		 246 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  71.56 
 
 		 246 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.09 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  66.98 
 
 		 245 aa  297  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.74 
 
 		 256 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  61.17 
 
 		 243 aa  241  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.48 
 
 		 275 aa  239  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  57.35 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  53.18 
 
 		 250 aa  221  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.67 
 
 		 241 aa  218  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  56.67 
 
 		 241 aa  218  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  55.12 
 
 		 243 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.19 
 
 		 240 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  53.55 
 
 		 236 aa  215  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.96 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  54.9 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  55.94 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.61 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.4 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  53.77 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  51.66 
 
 		 251 aa  208  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  51.83 
 
 		 261 aa  208  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 239 aa  207  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  53.59 
 
 		 242 aa  207  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  53.05 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.81 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 236 aa  205  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  48.37 
 
 		 241 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  50.72 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  50.7 
 
 		 243 aa  204  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  50.48 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.98 
 
 		 239 aa  203  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  52.38 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  51.18 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  47.91 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  53.08 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  48.82 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  52.38 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.29 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  48.39 
 
 		 243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.67 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  52.58 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  48.34 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  48.34 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  52.34 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.33 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  48.82 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  52.83 
 
 		 262 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.68 
 
 		 263 aa  194  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  46.26 
 
 		 245 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  51.55 
 
 		 239 aa  193  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 		 252 aa  192  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  48.08 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  46.73 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  50.71 
 
 		 232 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  46.19 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  53.14 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1936  two-component response regulator GltR  46.26 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  52.09 
 
 		 270 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.47 
 
 		 246 aa  187  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  51.3 
 
 		 244 aa  185  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  48.82 
 
 		 240 aa  184  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  48.82 
 
 		 240 aa  184  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0654  two component transcriptional regulator  55.37 
 
 		 244 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  44.55 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2909  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.999783  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  48.79 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 245 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  47.57 
 
 		 240 aa  181  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  47.57 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>